95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0108 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  593  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  43 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  47.87 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  41.03 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  40.33 
 
 		 330 aa  209  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  43.14 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  36.59 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  52.38 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  43.67 
 
 		 237 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.26 
 
 		 312 aa  192  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  42.17 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  45.07 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  36.48 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  36.33 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  34.94 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  43.06 
 
 		 321 aa  185  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  38.31 
 
 		 331 aa  185  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  43.36 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  47.17 
 
 		 313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  45.21 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.62 
 
 		 680 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  44.29 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  33.79 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  39.09 
 
 		 365 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  36.12 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  39.92 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  48.72 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  33.22 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  32.59 
 
 		 326 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  42.92 
 
 		 320 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  41.35 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  34.39 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  39.11 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  34.94 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  37.39 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  32.02 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  35.21 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  32.02 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  39.74 
 
 		 323 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  44.25 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  34.33 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  34.16 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  33.65 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  31.09 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  32.86 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  33.96 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  32.09 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  21.88 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  25.65 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  29.23 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 345 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 329 aa  52.4  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  26.38 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 365 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0710  Radical SAM domain protein  33.59 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  22.94 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.48 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0683  Radical SAM domain protein  33.59 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.48 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.21 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.45 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.32 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 434 aa  47  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  24.51 
 
 		 445 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.55 
 
 		 366 aa  46.6  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  31.96 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  19.6 
 
 		 369 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  20.78 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.07 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0471  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.91 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.918131  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2557  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.82 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  30.08 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  20.86 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.56 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  25.54 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 421 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.74 
 
 		 317 aa  42.7  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  27.74 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 428 aa  42.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>