252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1586 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  100 
 
 		 356 aa  739    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  35.97 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  35.85 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  38.39 
 
 		 373 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2164  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.295283  normal  0.13164 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0177  radical SAM family protein  28.11 
 
 		 372 aa  151  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.698116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01061  hypothetical protein  28.25 
 
 		 387 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.392097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  21.82 
 
 		 354 aa  89.4  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 574 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  29.76 
 
 		 342 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2900  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  24.44 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  22.45 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.75 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  22.26 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  23.81 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  22.11 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  30.12 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  23.34 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  22.98 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  22 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  20.51 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.22 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  23.22 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  23.33 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20.61 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  23.7 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  18.73 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1849  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.2 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  26.14 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  21.45 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  29.27 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0608  coenzyme PQQ synthesis protein E  23 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  30.7 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  21.47 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  22.03 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  25.51 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  19 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  18.31 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 		 377 aa  57  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  23.33 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0429  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.9 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.16 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  22.12 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  18.22 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  19.59 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  17.96 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  20.06 
 
 		 778 aa  55.1  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 334 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  22.48 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.97 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 287 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  23.51 
 
 		 327 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  25.57 
 
 		 447 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  20.31 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  23 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  21.99 
 
 		 323 aa  53.9  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.55 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2335  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.28 
 
 		 340 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.228355  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2293  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.28 
 
 		 340 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 445 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 434 aa  53.5  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  19.1 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  20.56 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  22.73 
 
 		 342 aa  53.1  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  19.72 
 
 		 374 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  20.95 
 
 		 398 aa  53.1  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  23.45 
 
 		 873 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  20.89 
 
 		 317 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>