73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0530 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  100 
 
 		 302 aa  604  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  64.77 
 
 		 300 aa  381  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  63.42 
 
 		 300 aa  378  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  64.43 
 
 		 300 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  54.7 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  51.52 
 
 		 304 aa  311  6.999999999999999e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  50.51 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  48.84 
 
 		 303 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  43.88 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  41.14 
 
 		 310 aa  237  1e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  41.72 
 
 		 303 aa  232  6e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  32.09 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  30.1 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.22 
 
 		 680 aa  138  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  34.95 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  33.65 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  27.78 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 239 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  31.2 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 		 237 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 314 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  32.19 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.54 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  34.52 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  26.28 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  32.29 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  29.05 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  29.49 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  28.02 
 
 		 270 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 267 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  29.07 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  22.91 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  21.01 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  23.9 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 365 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  30.28 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  22.73 
 
 		 341 aa  52.4  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  22.7 
 
 		 267 aa  49.3  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  31 
 
 		 497 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  23.28 
 
 		 416 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.1 
 
 		 339 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  20.51 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  22.78 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.73 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.83 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 		 565 aa  43.5  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  25.64 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  24.79 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  26.13 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.57 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>