38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1206 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  100 
 
 		 325 aa  677    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  74.61 
 
 		 345 aa  523  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  76.51 
 
 		 330 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  73.67 
 
 		 350 aa  513  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  46.29 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  44.95 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  44.48 
 
 		 299 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  45.14 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  45.77 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  40.91 
 
 		 358 aa  239  5e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  43.25 
 
 		 306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  41.84 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  38.11 
 
 		 313 aa  228  8e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  37.58 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  43.82 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  37.46 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  37.46 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  36.25 
 
 		 319 aa  222  7e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  39.74 
 
 		 361 aa  218  7.999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  41.84 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  33.97 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  37.54 
 
 		 515 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  39.86 
 
 		 351 aa  196  7e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  35.84 
 
 		 708 aa  194  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  39.19 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  37.28 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  39.51 
 
 		 351 aa  192  6e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  37.37 
 
 		 311 aa  192  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  34.72 
 
 		 416 aa  187  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  39.35 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  34.44 
 
 		 786 aa  172  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  22.09 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  30.28 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  21.46 
 
 		 354 aa  46.2  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  23.72 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>