40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2214 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 		 297 aa  617  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  66.78 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  64.41 
 
 		 297 aa  381  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  59.18 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  53.87 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  49.66 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  48.11 
 
 		 299 aa  261  6.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  46.08 
 
 		 316 aa  257  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  45.58 
 
 		 350 aa  253  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  45.77 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  44.13 
 
 		 345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  44.64 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  43.42 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  38.91 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  38.91 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  38.26 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  38.57 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  35.76 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  41.86 
 
 		 364 aa  202  5e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  35.95 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  38.51 
 
 		 361 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  37.87 
 
 		 358 aa  188  8e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  37.69 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  39.2 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  36.45 
 
 		 358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  39.2 
 
 		 351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  36.76 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  37.04 
 
 		 416 aa  176  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  37.59 
 
 		 515 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  33.81 
 
 		 708 aa  160  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  35.84 
 
 		 786 aa  159  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  22.31 
 
 		 354 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1448  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  35 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  22.93 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.75 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11040  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  23.04 
 
 		 231 aa  42.7  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.219865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>