36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0476 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  100 
 
 		 308 aa  637    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  48.85 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  50.67 
 
 		 345 aa  294  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  50 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  48.52 
 
 		 358 aa  279  4e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  48.03 
 
 		 316 aa  277  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  45.48 
 
 		 299 aa  258  9e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  45.8 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  45.14 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  46.5 
 
 		 350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  45.99 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  42.53 
 
 		 313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  41.04 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  42.21 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  42.21 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  40.13 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  40.93 
 
 		 416 aa  229  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  40.43 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  40.13 
 
 		 515 aa  227  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  41.53 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  43.23 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  41.81 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  40.18 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  38.82 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  42.47 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  39.57 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  38.93 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  40.25 
 
 		 380 aa  206  5e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  37.28 
 
 		 708 aa  199  3.9999999999999996e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  38.35 
 
 		 786 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  36.63 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 501 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0647  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.99 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  26.95 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>