52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1233 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 		 313 aa  647    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  98.08 
 
 		 313 aa  638    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  95.85 
 
 		 313 aa  625  1e-178  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  76.04 
 
 		 313 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  69.13 
 
 		 319 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  42.72 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  42.21 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  40.13 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  39.55 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  41.39 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  36.69 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  37.46 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  39.42 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  36.07 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  36.07 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  38.57 
 
 		 297 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  40 
 
 		 341 aa  206  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  35.18 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  35.64 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  37.15 
 
 		 380 aa  186  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  35.84 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  35.42 
 
 		 351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  37.25 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  35.2 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  35.53 
 
 		 358 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  35.4 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  33.22 
 
 		 358 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  33.02 
 
 		 708 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  35.45 
 
 		 786 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  34.49 
 
 		 515 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  33.89 
 
 		 416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  31.36 
 
 		 282 aa  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 414 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  36.36 
 
 		 236 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0829  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.85 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1027  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.41 
 
 		 242 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.290473  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  31.08 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 332 aa  42.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  31.08 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  31.08 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  31.08 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  31.08 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  31.08 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  31.08 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  31.08 
 
 		 292 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  31.08 
 
 		 292 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>