50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1372 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 		 358 aa  740    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  64.14 
 
 		 358 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  62.68 
 
 		 351 aa  451  1e-125  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  61.08 
 
 		 380 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  62.28 
 
 		 351 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  51.56 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  40.43 
 
 		 308 aa  230  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  38.79 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  37.43 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  37.99 
 
 		 361 aa  209  5e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  40.5 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  37.2 
 
 		 350 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  36.96 
 
 		 345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  38.75 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  38.12 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  39.56 
 
 		 358 aa  196  6e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  37.28 
 
 		 325 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  37.35 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  35.08 
 
 		 306 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  35.4 
 
 		 313 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  36.12 
 
 		 297 aa  179  9e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  35.4 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  35.09 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  35.09 
 
 		 313 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  34.75 
 
 		 311 aa  169  9e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  35.53 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  35 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  34.9 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  34.17 
 
 		 708 aa  159  7e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  34.78 
 
 		 786 aa  155  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  35.35 
 
 		 416 aa  149  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  24.15 
 
 		 310 aa  53.5  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 		 300 aa  50.1  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0907  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  22.45 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  20.69 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0544  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.29 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  20.69 
 
 		 300 aa  46.6  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  20.69 
 
 		 300 aa  46.2  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  23.02 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  20.51 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  25.57 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1202  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.07 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  21.3 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.92 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.53 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2621  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.63 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1192  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.78 
 
 		 255 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.6 
 
 		 337 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1058  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  32.2 
 
 		 244 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448399  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  32.03 
 
 		 287 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>