32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21682 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  100 
 
 
416 aa  872    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  57.11 
 
 
515 aa  488  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  46.89 
 
 
708 aa  382  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  49.49 
 
 
786 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  40.93 
 
 
308 aa  229  5e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  37.91 
 
 
345 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  35.69 
 
 
350 aa  190  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  34.72 
 
 
325 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  37.93 
 
 
330 aa  186  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  33.33 
 
 
361 aa  186  8e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  37.45 
 
 
316 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  38.26 
 
 
358 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  34.23 
 
 
364 aa  179  9e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  33.33 
 
 
345 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  35.74 
 
 
299 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  37.04 
 
 
297 aa  171  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  34.04 
 
 
341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  35.74 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  33.88 
 
 
319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  35.89 
 
 
303 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  38.58 
 
 
311 aa  158  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  35.53 
 
 
380 aa  152  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  35.35 
 
 
358 aa  149  9e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  33.68 
 
 
313 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  33.89 
 
 
313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  34.08 
 
 
297 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  33.56 
 
 
313 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  32.53 
 
 
313 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  35.29 
 
 
351 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  34.84 
 
 
358 aa  144  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  34.3 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  23.28 
 
 
302 aa  47.4  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>