59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0084 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  87.75 
 
 		 358 aa  653    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 		 351 aa  726    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  96.01 
 
 		 351 aa  701    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  82.86 
 
 		 380 aa  623  1e-177  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  62.28 
 
 		 358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  48.85 
 
 		 341 aa  351  1e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  40.18 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  38.73 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  39.56 
 
 		 364 aa  209  7e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  41.98 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  39.63 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  40.49 
 
 		 330 aa  199  9e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  37.22 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  40.65 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  37.34 
 
 		 350 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  35.91 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  39.08 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  39.51 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  35.2 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  36.72 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  35.2 
 
 		 313 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  38.89 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  34.07 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  33.44 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  37.79 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  37.42 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  38.87 
 
 		 297 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  34.8 
 
 		 786 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  31.87 
 
 		 708 aa  152  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  33.14 
 
 		 515 aa  150  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  35.29 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.27 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1192  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.32 
 
 		 255 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  20.09 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  21.27 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  20.81 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1202  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.92 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.78 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.35 
 
 		 338 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.22 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.83 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00708242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.54 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3594  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.96 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.83 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.589823  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.35 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3584  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.96 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4200  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.25 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341727  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  22.12 
 
 		 680 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1058  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.89 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3677  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.44 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1640  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.44 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18280  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.01 
 
 		 231 aa  43.5  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2732  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  27.14 
 
 		 231 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.107407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  24.48 
 
 		 328 aa  43.1  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3894  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.31 
 
 		 232 aa  43.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3363  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.32 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3627  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.32 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.37 
 
 		 319 aa  42.7  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>