49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1737 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 
316 aa  656    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  67.2 
 
 
345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  46.71 
 
 
299 aa  290  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  44.95 
 
 
325 aa  286  4e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  45.74 
 
 
330 aa  278  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  48.03 
 
 
308 aa  277  2e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  44.52 
 
 
345 aa  276  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  45.58 
 
 
350 aa  276  4e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  48.24 
 
 
303 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  44.64 
 
 
306 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  46.08 
 
 
297 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  43.3 
 
 
297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  43.09 
 
 
319 aa  241  9e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  42.43 
 
 
313 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  44.48 
 
 
311 aa  240  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  40.78 
 
 
313 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  43.33 
 
 
361 aa  236  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  41.61 
 
 
358 aa  235  7e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  40.13 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  40.13 
 
 
313 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  41.86 
 
 
364 aa  227  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  38.11 
 
 
341 aa  217  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  37.74 
 
 
351 aa  199  7e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  37.22 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  39.12 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  38.71 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  37.35 
 
 
358 aa  191  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  37.14 
 
 
515 aa  186  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  34.21 
 
 
708 aa  183  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  37.45 
 
 
416 aa  182  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  34.36 
 
 
786 aa  179  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1192  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0907  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.17 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1058  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  24.26 
 
 
244 aa  50.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448399  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2621  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.25 
 
 
245 aa  49.7  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0647  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.93 
 
 
229 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 
303 aa  46.2  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  25.23 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1448  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  30.23 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  29.09 
 
 
327 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 
436 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11040  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.45 
 
 
231 aa  43.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.219865  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0104  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.72 
 
 
256 aa  43.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 
300 aa  42.7  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 
308 aa  42.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  19.79 
 
 
483 aa  42.7  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 
501 aa  42.7  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>