48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0538 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 		 311 aa  650    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  56.07 
 
 		 303 aa  319  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  51.66 
 
 		 306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  55.15 
 
 		 297 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  53.87 
 
 		 297 aa  298  5e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  44.48 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  43.52 
 
 		 345 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  41 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  39.13 
 
 		 330 aa  205  7e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  38.85 
 
 		 350 aa  202  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  37.84 
 
 		 341 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  38.78 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  37.37 
 
 		 325 aa  192  9e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  36.89 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  36.05 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  37.25 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  37.25 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  38.7 
 
 		 313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  36.16 
 
 		 313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  36.63 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  36.84 
 
 		 358 aa  182  6e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  36.84 
 
 		 351 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  37.79 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  34.75 
 
 		 358 aa  169  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  34.63 
 
 		 361 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  35.92 
 
 		 364 aa  166  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  37.01 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  38.58 
 
 		 416 aa  158  9e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  35.45 
 
 		 515 aa  157  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  37.12 
 
 		 786 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  31.68 
 
 		 708 aa  140  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.18 
 
 		 399 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.57 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  25 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.85 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  29.58 
 
 		 776 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 481 aa  42.7  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1824  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 399 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 267 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>