35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1932 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  100 
 
 		 361 aa  757    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  75.21 
 
 		 364 aa  594  1e-169  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  48.85 
 
 		 308 aa  298  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  44.67 
 
 		 345 aa  249  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  42.19 
 
 		 299 aa  242  7e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  43.33 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  40 
 
 		 319 aa  237  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  40.45 
 
 		 330 aa  233  5e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  43.15 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  39.55 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  39.55 
 
 		 313 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  39.32 
 
 		 358 aa  226  6e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  38.26 
 
 		 313 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  39.74 
 
 		 325 aa  218  8.999999999999998e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  41.78 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  37.94 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  38.73 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  37.8 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  38.58 
 
 		 358 aa  210  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  37.99 
 
 		 358 aa  209  5e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  36.42 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  36.68 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  39.29 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  36.31 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  37.66 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  33.84 
 
 		 708 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  33.33 
 
 		 416 aa  186  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  36.04 
 
 		 306 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  36.49 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  32.64 
 
 		 786 aa  179  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  34.63 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2621  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  24.72 
 
 		 245 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3029  glycyl-radical enzyme activating protein family  24.14 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.59 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  27.37 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>