More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1353 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  100 
 
 		 371 aa  773    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  67.49 
 
 		 382 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  67.95 
 
 		 369 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  67.21 
 
 		 382 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  67.57 
 
 		 382 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  65.14 
 
 		 381 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  64.86 
 
 		 381 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40320  hypothetical protein  65.31 
 
 		 381 aa  504  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  66.39 
 
 		 382 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  65.49 
 
 		 378 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  64.86 
 
 		 381 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.8 
 
 		 398 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  65.76 
 
 		 379 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  64.86 
 
 		 381 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  65.47 
 
 		 375 aa  481  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  59.19 
 
 		 376 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1905  radical SAM protein  61.96 
 
 		 403 aa  456  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0679  hypothetical protein  59.27 
 
 		 409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0648  hypothetical protein  59.27 
 
 		 413 aa  451  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  57.58 
 
 		 362 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.82 
 
 		 380 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1716  radical SAM protein  56.79 
 
 		 401 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973881  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1780  hypothetical protein  56.79 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  53.4 
 
 		 382 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  55.28 
 
 		 377 aa  418  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  55.96 
 
 		 370 aa  420  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02409  predicted enzyme  57.87 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1151  radical SAM enzyme, Cfr family  57.87 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.390398  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2669  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2764  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2801  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1160  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0206768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3742  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02371  hypothetical protein  57.87 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  54.79 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2895  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1183  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.42 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2720  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.564025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1290  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.42 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2677  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  55.77 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3612  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.83 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2783  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.355164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2668  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0421  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.42 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.662236  hitchhiker  0.00298691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  55.43 
 
 		 383 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  55.1 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.02 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  55.34 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  55.01 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01053  radical SAM enzyme, Cfr family  56.25 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1115  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.99 
 
 		 392 aa  411  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3017  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.08 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2740  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.15 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1255  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.55 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1657  radical SAM enzyme, Cfr family  56.4 
 
 		 401 aa  411  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33058  normal  0.466299 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06113  radical SAM enzyme, Cfr family  56.25 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245547  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1198  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.9 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.347563  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  54.52 
 
 		 383 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1165  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  58.17 
 
 		 372 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665651  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  57.06 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4255  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.57 
 
 		 386 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.15 
 
 		 373 aa  408  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  55.43 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.87 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  54.12 
 
 		 382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.87 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.02 
 
 		 372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  54.29 
 
 		 365 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.15 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.15 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2543  radical SAM enzyme, Cfr family  54.4 
 
 		 383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180565  hitchhiker  0.00648935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.87 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.56 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.87 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.71 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.32 
 
 		 373 aa  401  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.6 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  53.85 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  54.1 
 
 		 364 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5115  hypothetical protein  54.71 
 
 		 379 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.87 
 
 		 373 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0888845  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1422  radical SAM protein  53.77 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12366  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.15 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.27 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0016411  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  54.97 
 
 		 379 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1461  radical SAM protein  54.86 
 
 		 378 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0453987  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.6 
 
 		 373 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1752  radical SAM protein  54.71 
 
 		 379 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1814  radical SAM protein  54.97 
 
 		 379 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1838  radical SAM protein  54.97 
 
 		 379 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1725  radical SAM protein  54.45 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.32 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1837  radical SAM protein  54.13 
 
 		 378 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2230  radical SAM protein  54.13 
 
 		 378 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1592  hypothetical protein  53.63 
 
 		 383 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  54.02 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  54.37 
 
 		 382 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  54.13 
 
 		 378 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>