266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3029 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3029  glycyl-radical enzyme activating protein family  100 
 
 		 260 aa  530  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0325  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  50.97 
 
 		 258 aa  278  9e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.719518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1938  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.22 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.239617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1247  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.86 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  34.77 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.97 
 
 		 305 aa  184  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2752  glycyl-radical activating family protein  34.81 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1175  glycyl-radical activating family protein  38.46 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0579151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1272  radical-activating enzyme  35.69 
 
 		 309 aa  178  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2500  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.02 
 
 		 294 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0168  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.43 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  34.45 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1073  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.02 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1586  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.29 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0487316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3281  radical-activating enzyme  35.05 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  36.27 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.97 
 
 		 316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.59 
 
 		 310 aa  165  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.48 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1418  glycyl-radical activating family protein  36.93 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0980  glycyl-radical activating family protein  38.31 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  35.18 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3054  radical-activating enzyme  34.83 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.969131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2102  pyruvate formate-lyase-activating enzyme, putative  31.82 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.510382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0916  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  35.03 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0858803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1358  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.14 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3715  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.53 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0490  glycyl-radical activating family protein  32.31 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.164514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  34.69 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  33 
 
 		 318 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0367  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.56 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2966  glycyl-radical activating family protein  35.42 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4034  glycyl-radical enzyme activating protein family  30.55 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.69 
 
 		 301 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4438  pyruvate formate lyase II activase  30.55 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4446  pyruvate formate lyase II activase  31.44 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.193926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  32.27 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4399  pyruvate formate lyase II activase  30.55 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.710487  normal  0.473369 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4064  pyruvate formate lyase II activase  30.55 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4520  pyruvate formate lyase II activase  31.44 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000270977 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03837  pyruvate formate lyase II activase  30.18 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4491  pyruvate formate lyase II activase  30.18 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.730323  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4186  pyruvate formate lyase II activase  30.18 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03786  hypothetical protein  30.18 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3704  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.84 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5412  pyruvate formate lyase II activase  30.18 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.65 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2144  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.09 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0297  pyruvate formate-lyase activating enzyme  34.69 
 
 		 247 aa  148  7e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1049  pyruvate formate lyase activating enzyme  33.33 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2719  pyruvate formate-lyase activating enzyme  36.03 
 
 		 241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1542  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.37 
 
 		 259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00863407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1671  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  32.65 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2884  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  32.4 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2391  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  31.5 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227753  normal  0.208715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3258  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.67 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.807185  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1707  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  31.5 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231805 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  34.52 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  32.13 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2379  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  31.2 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0648375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  32.81 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3308  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.77 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.760643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1894  pyruvate formate-lyase activating enzyme  31.85 
 
 		 334 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703525  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1435  glycyl-radical enzyme activating protein family  32.86 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2672  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.4 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.209524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2524  glycyl-radical enzyme activating protein family  32 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2691  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.4 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00335137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2770  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.4 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.789492  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2913  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.71 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1693  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.4 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1497  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.46 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  32.41 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  32.02 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  32.41 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  32.41 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0849  glycyl-radical activating family protein  32.42 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  35.89 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1560  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.31 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0861855  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1554  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.31 
 
 		 246 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.202343 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  31.62 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  32.02 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  31.62 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  31.62 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  35.89 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1493  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.92 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0621061  normal  0.601453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0995  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.46 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1318  glycyl-radical activating family protein  32.58 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0352967  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00791  predicted pyruvate formate lyase activating enzyme  31.33 
 
 		 308 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1541  glycyl-radical activating protein  33.92 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.883211  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00808  hypothetical protein  31.33 
 
 		 308 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0513  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  33.47 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2641  glycyl-radical activating family protein  30.03 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2820  glycyl-radical activating family protein  31.74 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0882  glycyl-radical activating family protein  31.74 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2818  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.74 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0912  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.74 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  31.62 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0974  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.74 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0895  glycyl-radical activating family protein  31.74 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0885  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.74 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>