50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2206 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  88.32 
 
 		 351 aa  657    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 		 358 aa  741    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  85.14 
 
 		 380 aa  646    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  87.75 
 
 		 351 aa  653    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  64.14 
 
 		 358 aa  459  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  49.71 
 
 		 341 aa  348  6e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  39.02 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  44.29 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  38.58 
 
 		 361 aa  210  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  38.82 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  41.46 
 
 		 345 aa  209  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  40 
 
 		 358 aa  198  9e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  38.71 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  39.15 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  39.19 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  38.38 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  39.64 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  36.88 
 
 		 313 aa  193  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  36.84 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  35.53 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  35.38 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  36.39 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  35.22 
 
 		 313 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  35.22 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  36.45 
 
 		 297 aa  177  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  36.42 
 
 		 303 aa  176  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  37.21 
 
 		 297 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  34.21 
 
 		 708 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  35.64 
 
 		 786 aa  156  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  31.38 
 
 		 515 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  34.84 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  21.46 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  21.46 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  21.46 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1192  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.41 
 
 		 255 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.34 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.72 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 365 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.2 
 
 		 341 aa  46.6  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.5 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.48 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18280  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.86 
 
 		 231 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1188  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.91 
 
 		 205 aa  43.5  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.9 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.02 
 
 		 338 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.26 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3894  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.44 
 
 		 232 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.64 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00708242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>