44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0866 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  85.14 
 
 		 358 aa  646    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 		 380 aa  782    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  83.43 
 
 		 351 aa  626  1e-178  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  82.86 
 
 		 351 aa  623  1e-177  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  61.08 
 
 		 358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  49.28 
 
 		 341 aa  342  5e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  42.99 
 
 		 299 aa  217  4e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  40.25 
 
 		 308 aa  206  7e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  37.97 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  36.31 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  37.66 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  39.12 
 
 		 316 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  40.19 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  37.18 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  37.15 
 
 		 313 aa  194  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  38.83 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  40.13 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  37.15 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  39.35 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  37.15 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  36.89 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  37.07 
 
 		 297 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  36.36 
 
 		 313 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  34.57 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  36.07 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  36.75 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  37.42 
 
 		 297 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  32.13 
 
 		 708 aa  161  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  33.44 
 
 		 786 aa  153  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  35.53 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  33.22 
 
 		 515 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  21.46 
 
 		 300 aa  53.5  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1192  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.94 
 
 		 255 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  21.08 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  21 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.05 
 
 		 321 aa  47  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.29 
 
 		 337 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1058  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.84 
 
 		 244 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448399  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.65 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.52 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 313 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4200  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.71 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341727  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  20.25 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.3 
 
 		 319 aa  43.5  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>