49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0138 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  98.08 
 
 		 313 aa  638    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 		 313 aa  645    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  96.49 
 
 		 313 aa  627  1e-179  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  76.36 
 
 		 313 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  69.13 
 
 		 319 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  43.04 
 
 		 345 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  42.53 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  40.78 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  38.11 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  39.55 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  41.39 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  37.34 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  39.74 
 
 		 364 aa  221  9e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  36.39 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  36.72 
 
 		 345 aa  216  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  38.91 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  36.16 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  40 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  36.52 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  37.37 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  37.15 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  35.42 
 
 		 351 aa  186  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  35.2 
 
 		 351 aa  183  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  37.25 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  35.22 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  35.4 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  33.11 
 
 		 358 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  35.19 
 
 		 515 aa  158  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  33.65 
 
 		 708 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  35.82 
 
 		 786 aa  156  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  33.56 
 
 		 416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0829  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.11 
 
 		 314 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 414 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  31.08 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  31.08 
 
 		 279 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  31.08 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  31.08 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  31.08 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  31.08 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  31.08 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  31.08 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  31.08 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>