50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2016 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 		 330 aa  678    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  76.51 
 
 		 325 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  73.1 
 
 		 345 aa  497  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  73.1 
 
 		 350 aa  493  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  47.87 
 
 		 345 aa  300  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  45.74 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  46.53 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  45.8 
 
 		 308 aa  252  6e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  39.35 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  44.13 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  42.47 
 
 		 358 aa  239  4e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  42.76 
 
 		 306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  38.76 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  40.45 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  41.5 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  37.34 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  36.69 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  41.28 
 
 		 297 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  36.33 
 
 		 313 aa  222  9e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  37.03 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  41.3 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  37.43 
 
 		 358 aa  209  4e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  40.61 
 
 		 515 aa  207  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  39.13 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  40.49 
 
 		 351 aa  199  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  40.14 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  35.08 
 
 		 708 aa  197  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  39.64 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  38.83 
 
 		 380 aa  189  5e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  37.93 
 
 		 416 aa  186  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  36.09 
 
 		 786 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  24.88 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 338 aa  49.7  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  24.42 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  29.13 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  32.84 
 
 		 533 aa  46.2  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.32 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1699  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.04 
 
 		 228 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  35.16 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1090  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 242 aa  43.5  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.67 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 302 aa  42.7  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>