56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2838 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 
306 aa  642    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  58.59 
 
 
297 aa  354  1e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  57.93 
 
 
303 aa  352  4e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  54.75 
 
 
297 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  51.66 
 
 
311 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  42.76 
 
 
345 aa  260  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  45.24 
 
 
299 aa  256  5e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  44.64 
 
 
316 aa  253  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  43.25 
 
 
325 aa  236  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  42.76 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  43.01 
 
 
350 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  41.92 
 
 
345 aa  229  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  41.81 
 
 
308 aa  222  6e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  35.31 
 
 
313 aa  211  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  36.16 
 
 
313 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  35.18 
 
 
313 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  39.07 
 
 
358 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  35.18 
 
 
313 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  35.49 
 
 
341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  34.22 
 
 
319 aa  196  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  36.48 
 
 
364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  36.72 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  36.04 
 
 
361 aa  182  8.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  35.08 
 
 
358 aa  182  9.000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  36.39 
 
 
358 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  36.39 
 
 
351 aa  180  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  36.07 
 
 
380 aa  176  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  35.74 
 
 
416 aa  165  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  35.03 
 
 
515 aa  160  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  33.56 
 
 
786 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  31.76 
 
 
708 aa  153  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  23.5 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  26.23 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  25.24 
 
 
310 aa  47  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 
351 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.51 
 
 
330 aa  46.2  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  20.96 
 
 
354 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  30.2 
 
 
200 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  24.65 
 
 
462 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 
497 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3584  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.24 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3627  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.24 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.24 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.589823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3363  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.24 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.24 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3594  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.24 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.24 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00708242  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3677  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.24 
 
 
338 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 
215 aa  42.7  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 
300 aa  42.7  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>