82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1226 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  100 
 
 
200 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  42.29 
 
 
215 aa  177  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  46.19 
 
 
464 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  45.69 
 
 
210 aa  174  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  43.94 
 
 
457 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 
197 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  42.93 
 
 
462 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  44.95 
 
 
461 aa  165  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  44.09 
 
 
206 aa  164  8e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  44.95 
 
 
202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  45.6 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  38.89 
 
 
462 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  43.59 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  38.27 
 
 
458 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0889  radical SAM domain-containing protein  41.03 
 
 
200 aa  151  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  37.76 
 
 
458 aa  151  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  39.9 
 
 
606 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2745  hypothetical protein  40.61 
 
 
212 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  41.41 
 
 
200 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0657  radical SAM domain-containing protein  42.05 
 
 
210 aa  145  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.872238  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0944  hypothetical protein  40.93 
 
 
262 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  40.93 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  39.09 
 
 
454 aa  140  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3236  radical SAM domain-containing protein  40.41 
 
 
241 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0787  radical SAM domain-containing protein  40.41 
 
 
241 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3339  radical SAM domain-containing protein  40.41 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0837  radical SAM domain-containing protein  40.93 
 
 
235 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3455  Radical SAM domain protein  40.93 
 
 
235 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3530  radical SAM domain-containing protein  40.93 
 
 
235 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  36.6 
 
 
459 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3649  radical SAM domain-containing protein  40.41 
 
 
235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  37.69 
 
 
244 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  38.19 
 
 
224 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  37.06 
 
 
225 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  37.69 
 
 
213 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  32.84 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 
287 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 
287 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 
287 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.24 
 
 
347 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0512  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 
491 aa  52.4  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.158097  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20010  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.32 
 
 
338 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0117672 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29673  predicted protein  27.27 
 
 
174 aa  49.3  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00157248 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27237  predicted protein  27.27 
 
 
174 aa  49.3  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0943  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 
287 aa  48.9  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 
310 aa  48.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1444  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.78 
 
 
380 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000773011 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  30.2 
 
 
306 aa  45.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1233  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.87 
 
 
365 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.73 
 
 
337 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  22.6 
 
 
354 aa  45.4  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 
314 aa  45.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2126  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.49 
 
 
336 aa  45.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.01 
 
 
333 aa  45.1  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.32 
 
 
337 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.11 
 
 
348 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.68 
 
 
346 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.49 
 
 
298 aa  43.9  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  29.09 
 
 
321 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.09 
 
 
328 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 
303 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.74 
 
 
328 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0514  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.19 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1348  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.41 
 
 
329 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.77 
 
 
312 aa  43.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.85 
 
 
329 aa  42.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0363  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 
327 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal  0.816586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.23 
 
 
341 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  34.18 
 
 
447 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  22.47 
 
 
346 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1832  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.49 
 
 
380 aa  42  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1019  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.71 
 
 
328 aa  42.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.33881  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0422  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 
299 aa  42.4  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.2652  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 
351 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0124  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.35 
 
 
338 aa  42  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592578  normal  0.0245829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.41 
 
 
333 aa  42  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.39 
 
 
335 aa  42  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.32 
 
 
326 aa  41.6  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.3 
 
 
329 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 
355 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.91 
 
 
323 aa  41.6  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2852  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.82 
 
 
444 aa  41.6  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>