43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0837 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0837  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
235 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3455  Radical SAM domain protein  98.72 
 
 
235 aa  480  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3530  radical SAM domain-containing protein  98.3 
 
 
235 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3649  radical SAM domain-containing protein  97.87 
 
 
235 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3236  radical SAM domain-containing protein  89.95 
 
 
241 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0787  radical SAM domain-containing protein  89.95 
 
 
241 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  82.13 
 
 
235 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3339  radical SAM domain-containing protein  89.45 
 
 
239 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0944  hypothetical protein  85.97 
 
 
262 aa  400  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  76.77 
 
 
224 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  73.87 
 
 
200 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0889  radical SAM domain-containing protein  73.87 
 
 
200 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  74.49 
 
 
202 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2745  hypothetical protein  65.87 
 
 
212 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0657  radical SAM domain-containing protein  61.9 
 
 
210 aa  264  8e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.872238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  41.82 
 
 
459 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  43.94 
 
 
458 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  44.44 
 
 
458 aa  158  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  40.2 
 
 
462 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  42.35 
 
 
457 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  45.31 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  40.82 
 
 
606 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  44.51 
 
 
464 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  41.84 
 
 
462 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  44.5 
 
 
461 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  40.93 
 
 
200 aa  138  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  35.79 
 
 
197 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  35.57 
 
 
206 aa  109  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  32.5 
 
 
454 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  34.91 
 
 
244 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  34.65 
 
 
225 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 
215 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 
224 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  35.38 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 
355 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 
372 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  27.34 
 
 
338 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1235  radical SAM family protein  31.85 
 
 
470 aa  42.4  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0608  coenzyme PQQ synthesis protein E  33.04 
 
 
330 aa  41.6  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051547  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 
443 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  28 
 
 
351 aa  41.6  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>