122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0309 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  100 
 
 
197 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  48.44 
 
 
198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 
200 aa  169  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  39.9 
 
 
210 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  43.08 
 
 
464 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  42.13 
 
 
462 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  39.9 
 
 
458 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  40 
 
 
457 aa  154  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  44.1 
 
 
454 aa  152  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  38.34 
 
 
458 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  41.45 
 
 
606 aa  151  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  40.61 
 
 
215 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  40 
 
 
461 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  38.97 
 
 
462 aa  148  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  39.59 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  35.75 
 
 
459 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  38.42 
 
 
224 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  35.75 
 
 
202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0889  radical SAM domain-containing protein  36.46 
 
 
200 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0944  hypothetical protein  36.84 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 
235 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0657  radical SAM domain-containing protein  36.32 
 
 
210 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.872238  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  34.74 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2745  hypothetical protein  35.79 
 
 
212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0837  radical SAM domain-containing protein  35.79 
 
 
235 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0787  radical SAM domain-containing protein  35.79 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3236  radical SAM domain-containing protein  35.79 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3455  Radical SAM domain protein  35.79 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3339  radical SAM domain-containing protein  35.79 
 
 
239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3530  radical SAM domain-containing protein  35.26 
 
 
235 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3649  radical SAM domain-containing protein  35.26 
 
 
235 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  33.67 
 
 
225 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  35 
 
 
244 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  35 
 
 
224 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  35 
 
 
213 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  33.01 
 
 
215 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47894  predicted protein  24.39 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 
384 aa  54.7  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 
308 aa  53.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  26.88 
 
 
356 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 
444 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0363  radical SAM domain-containing protein  22.16 
 
 
327 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal  0.816586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.41 
 
 
355 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 
310 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 
287 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 
287 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  30.85 
 
 
342 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.73 
 
 
355 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 
287 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  24.18 
 
 
312 aa  48.9  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.88 
 
 
361 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  31.01 
 
 
321 aa  48.9  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 
314 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1233  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.4 
 
 
365 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63882  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  27.74 
 
 
441 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  22.06 
 
 
446 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.85 
 
 
335 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 
316 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  22.06 
 
 
446 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 
445 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 
320 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 
313 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  22.06 
 
 
446 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.03 
 
 
351 aa  46.2  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.08 
 
 
347 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1027  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.290473  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.27 
 
 
317 aa  46.2  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.46 
 
 
320 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.03 
 
 
312 aa  45.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12087  predicted protein  30.77 
 
 
340 aa  45.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 
434 aa  45.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.91 
 
 
320 aa  45.1  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.73 
 
 
351 aa  45.1  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 
351 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.56 
 
 
429 aa  44.7  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.09 
 
 
348 aa  44.7  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.91 
 
 
320 aa  44.7  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.49 
 
 
334 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  26.87 
 
 
359 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  23.08 
 
 
340 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.48 
 
 
322 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000610838  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.62 
 
 
337 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0313  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.47 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.331207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 
351 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 
443 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.17 
 
 
340 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 
441 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.23 
 
 
351 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  25.64 
 
 
345 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.17 
 
 
340 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
359 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.16 
 
 
348 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.35 
 
 
338 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.19 
 
 
351 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 
450 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 
298 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  23.21 
 
 
680 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  27.75 
 
 
417 aa  43.1  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 
328 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.54 
 
 
332 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>