More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0301 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  60.32 
 
 		 215 aa  257  8e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  44.09 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  44.33 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  39.59 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.81 
 
 		 464 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 210 aa  131  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  41.33 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  37.44 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  39.18 
 
 		 457 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  37.44 
 
 		 459 aa  128  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  40.31 
 
 		 461 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0889  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  36.41 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  38.46 
 
 		 458 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0657  radical SAM domain-containing protein  35.58 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.872238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  40 
 
 		 244 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  38.14 
 
 		 458 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  38.02 
 
 		 606 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  38.89 
 
 		 462 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  37.95 
 
 		 462 aa  121  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  36.22 
 
 		 454 aa  121  8e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2745  hypothetical protein  35.9 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  35.05 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  39.39 
 
 		 224 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  39.49 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0944  hypothetical protein  35.57 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3455  Radical SAM domain protein  36.08 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0787  radical SAM domain-containing protein  35.05 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3236  radical SAM domain-containing protein  35.05 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  34.54 
 
 		 235 aa  111  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3339  radical SAM domain-containing protein  35.05 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3530  radical SAM domain-containing protein  35.57 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0837  radical SAM domain-containing protein  35.57 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3649  radical SAM domain-containing protein  35.57 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  30.24 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  32.05 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47894  predicted protein  27.45 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.63 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.52 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 333 aa  61.6  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.48 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.41 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  35.16 
 
 		 351 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0943  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27237  predicted protein  29.55 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29673  predicted protein  29.55 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00157248 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.61 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  37.6 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  32.04 
 
 		 397 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.94 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.71 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 489 aa  56.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  30.77 
 
 		 349 aa  55.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.91 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 		 333 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  33.86 
 
 		 351 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.81 
 
 		 346 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  31.01 
 
 		 399 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  27.68 
 
 		 399 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 384 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 		 384 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  29.63 
 
 		 341 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  30.3 
 
 		 390 aa  53.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  33.62 
 
 		 393 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.96 
 
 		 335 aa  52.8  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4990  radical SAM family protein  36 
 
 		 386 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.396764  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 330 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 487 aa  52.4  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 399 aa  52  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 398 aa  52  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.57 
 
 		 353 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  29.83 
 
 		 346 aa  52  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.95 
 
 		 296 aa  51.6  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 395 aa  51.6  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.47 
 
 		 341 aa  51.6  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.49 
 
 		 337 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.95 
 
 		 337 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.94 
 
 		 318 aa  51.6  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.98 
 
 		 359 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 377 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2557  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.59 
 
 		 330 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0058  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.92 
 
 		 310 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 582 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 		 404 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 399 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 389 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4135  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 		 326 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0152666 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.75 
 
 		 317 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  30.77 
 
 		 471 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  30.59 
 
 		 292 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.12 
 
 		 337 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 		 581 aa  49.3  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1019  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.6 
 
 		 328 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.33881  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  29.51 
 
 		 358 aa  49.3  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0739  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 347 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01723  hypothetical protein  31.63 
 
 		 375 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>