44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0797 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  78.28 
 
 		 224 aa  333  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  75.88 
 
 		 200 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0889  radical SAM domain-containing protein  75.38 
 
 		 200 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3455  Radical SAM domain protein  75 
 
 		 235 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3530  radical SAM domain-containing protein  74.49 
 
 		 235 aa  305  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3339  radical SAM domain-containing protein  73.98 
 
 		 239 aa  304  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0837  radical SAM domain-containing protein  74.49 
 
 		 235 aa  304  7e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3236  radical SAM domain-containing protein  73.98 
 
 		 241 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0787  radical SAM domain-containing protein  73.98 
 
 		 241 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0944  hypothetical protein  72.96 
 
 		 262 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  73.98 
 
 		 235 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3649  radical SAM domain-containing protein  73.98 
 
 		 235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2745  hypothetical protein  68.66 
 
 		 212 aa  295  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0657  radical SAM domain-containing protein  68.37 
 
 		 210 aa  284  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.872238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  49.75 
 
 		 459 aa  209  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  44.22 
 
 		 458 aa  166  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  43.07 
 
 		 462 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  43.72 
 
 		 458 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  44.95 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  42.36 
 
 		 457 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  42.79 
 
 		 606 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  44.61 
 
 		 461 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  42.29 
 
 		 462 aa  154  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  44.04 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  41.87 
 
 		 464 aa  151  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  35.75 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  38.07 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  37 
 
 		 215 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  35.15 
 
 		 454 aa  132  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  37.44 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  40 
 
 		 244 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  38.12 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  39.02 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  38.81 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  33.65 
 
 		 215 aa  111  6e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 		 351 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 351 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 355 aa  44.7  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.83 
 
 		 312 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47894  predicted protein  27.54 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.7 
 
 		 351 aa  42  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  28.12 
 
 		 338 aa  42  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0893  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 361 aa  41.6  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.910266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>