49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1159 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  37.56 
 
 		 198 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  36.59 
 
 		 606 aa  126  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  38.24 
 
 		 464 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  35.96 
 
 		 462 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  37.75 
 
 		 461 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  35.12 
 
 		 462 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  34.47 
 
 		 458 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  34.8 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  33.5 
 
 		 458 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0889  radical SAM domain-containing protein  33.99 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  34.63 
 
 		 457 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  33.65 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  34.98 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  32.84 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  33.01 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  33.66 
 
 		 459 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0837  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3455  Radical SAM domain protein  33.5 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3649  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3530  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0944  hypothetical protein  33.99 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  33.01 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3236  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3339  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0787  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  31.55 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0657  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.872238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2745  hypothetical protein  30.24 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  30.24 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  30.73 
 
 		 244 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  28.78 
 
 		 454 aa  86.3  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 574 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29673  predicted protein  27.38 
 
 		 174 aa  45.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00157248 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27237  predicted protein  27.38 
 
 		 174 aa  45.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1166  radical SAM enzyme, Cfr family  26.53 
 
 		 359 aa  45.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.565735 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2074  radical SAM protein  34.34 
 
 		 347 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.643196  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49687  predicted protein  27.81 
 
 		 369 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.622489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  23.44 
 
 		 306 aa  42.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3613  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.37 
 
 		 352 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0340867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.81 
 
 		 355 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.93 
 
 		 340 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.28 
 
 		 356 aa  41.6  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.93 
 
 		 340 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.61 
 
 		 429 aa  41.2  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>