More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2238 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  100 
 
 
457 aa  949    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  66.23 
 
 
606 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  65.86 
 
 
461 aa  641    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  64.47 
 
 
462 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  62.45 
 
 
462 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  62.28 
 
 
458 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  61.4 
 
 
458 aa  608  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  55.56 
 
 
464 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  41.83 
 
 
459 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  39.35 
 
 
454 aa  346  5e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  49.61 
 
 
257 aa  259  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  60.21 
 
 
210 aa  249  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  48.64 
 
 
256 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  45.88 
 
 
256 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  45.67 
 
 
256 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  45.67 
 
 
256 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  43.36 
 
 
257 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  46.61 
 
 
256 aa  236  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  42.52 
 
 
255 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  42.52 
 
 
255 aa  233  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  42.52 
 
 
255 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.52 
 
 
255 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  45 
 
 
261 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  42.52 
 
 
255 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  42.52 
 
 
255 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.52 
 
 
255 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.52 
 
 
255 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  47.22 
 
 
264 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  42.52 
 
 
255 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.52 
 
 
255 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  42.13 
 
 
255 aa  229  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  41.73 
 
 
256 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  44.27 
 
 
258 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  50.59 
 
 
261 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  48.25 
 
 
256 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  43.36 
 
 
255 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  43.25 
 
 
256 aa  223  7e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  45.17 
 
 
264 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  42.25 
 
 
255 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  40.16 
 
 
256 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  44.05 
 
 
268 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  44.71 
 
 
257 aa  217  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  42.29 
 
 
253 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  42.41 
 
 
273 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  39.45 
 
 
255 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  44.4 
 
 
271 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  41.25 
 
 
268 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  42.75 
 
 
264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  40.48 
 
 
256 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  44.31 
 
 
270 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  39.53 
 
 
256 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  39.53 
 
 
256 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  41.8 
 
 
278 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  42.75 
 
 
255 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  46.27 
 
 
258 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  45.88 
 
 
258 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  46.27 
 
 
258 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  42.29 
 
 
255 aa  210  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  40.16 
 
 
267 aa  209  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  40.15 
 
 
260 aa  208  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  42.13 
 
 
263 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  41.41 
 
 
259 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  42.37 
 
 
267 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  42.29 
 
 
258 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  43.53 
 
 
259 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  40.7 
 
 
276 aa  206  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  40.87 
 
 
254 aa  206  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  40.94 
 
 
260 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  41.73 
 
 
257 aa  204  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  40.94 
 
 
251 aa  204  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  40.71 
 
 
260 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  38.49 
 
 
263 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  38.89 
 
 
276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  38.58 
 
 
271 aa  201  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40.47 
 
 
255 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  40 
 
 
262 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  41.41 
 
 
257 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  40.08 
 
 
255 aa  199  7e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  40.78 
 
 
258 aa  199  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  42.08 
 
 
262 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  40.7 
 
 
273 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  38.71 
 
 
265 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  41.31 
 
 
277 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  44.88 
 
 
257 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  42.25 
 
 
273 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  40.78 
 
 
266 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  40.48 
 
 
257 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  41.18 
 
 
270 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  40.16 
 
 
259 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  37.93 
 
 
258 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  38 
 
 
251 aa  196  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  39.61 
 
 
256 aa  196  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  39.22 
 
 
257 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  39.3 
 
 
258 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  39.45 
 
 
274 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  38.98 
 
 
262 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  42.35 
 
 
264 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  41.67 
 
 
259 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  41.25 
 
 
264 aa  194  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  41.02 
 
 
259 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>