More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_49687 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_49687  predicted protein  100 
 
 
369 aa  761    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.622489 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12087  predicted protein  49.85 
 
 
340 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.74 
 
 
361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  46.96 
 
 
356 aa  306  5.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16031  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.86 
 
 
356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  45.51 
 
 
367 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.09 
 
 
355 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.22 
 
 
340 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.8 
 
 
355 aa  295  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.93 
 
 
340 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1574  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.09 
 
 
348 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  42.9 
 
 
345 aa  285  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16851  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.81 
 
 
348 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.3 
 
 
351 aa  281  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.24 
 
 
347 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.3 
 
 
351 aa  279  6e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.58 
 
 
356 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16611  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.97 
 
 
348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.785393  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1012  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.31 
 
 
359 aa  271  9e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18821  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.31 
 
 
359 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  41.76 
 
 
351 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  41.46 
 
 
349 aa  240  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  42.55 
 
 
344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  39.82 
 
 
356 aa  229  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  41.11 
 
 
378 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  38.19 
 
 
408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  39.16 
 
 
377 aa  225  8e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.81 
 
 
343 aa  225  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.1 
 
 
367 aa  222  6e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.92 
 
 
343 aa  222  8e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  38.48 
 
 
348 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  37.5 
 
 
392 aa  220  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  36.36 
 
 
357 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  39.58 
 
 
364 aa  220  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.13 
 
 
364 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
398 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.22 
 
 
430 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  38.75 
 
 
370 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.96 
 
 
373 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.76 
 
 
373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  38.3 
 
 
342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.03 
 
 
373 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.32 
 
 
361 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.76 
 
 
373 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.76 
 
 
373 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.03 
 
 
373 aa  216  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.96 
 
 
353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.57 
 
 
373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.64 
 
 
341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.3 
 
 
373 aa  216  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.76 
 
 
373 aa  215  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  37.33 
 
 
372 aa  215  9e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.92 
 
 
373 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3115  radical SAM enzyme, Cfr family  37.65 
 
 
353 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248396  hitchhiker  0.0000000842526 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.76 
 
 
373 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.76 
 
 
373 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  37.67 
 
 
369 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07736  hypothetical protein  35.69 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.49 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  41.57 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.13 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.12 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0726  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.27 
 
 
383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.96 
 
 
380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  37.9 
 
 
371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.26 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.26 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1429  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.03 
 
 
373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0876618 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.2 
 
 
373 aa  212  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0016411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  37.27 
 
 
376 aa  212  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.49 
 
 
373 aa  212  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  37.85 
 
 
360 aa  212  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  37.5 
 
 
379 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.33 
 
 
386 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.22 
 
 
373 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0888845  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  37.7 
 
 
370 aa  212  9e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  37.7 
 
 
370 aa  212  9e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1183  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.1 
 
 
398 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  38.69 
 
 
366 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.36 
 
 
342 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3612  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.3 
 
 
398 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0421  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.1 
 
 
398 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.662236  hitchhiker  0.00298691 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  38.2 
 
 
372 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1290  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.1 
 
 
398 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  36.22 
 
 
381 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  36.22 
 
 
381 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  36.22 
 
 
381 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  36.58 
 
 
382 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.36 
 
 
354 aa  210  4e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.41 
 
 
348 aa  210  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.83 
 
 
375 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.28 
 
 
362 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.98 
 
 
362 aa  209  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  36.72 
 
 
378 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.61 
 
 
380 aa  209  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.28 
 
 
362 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  36.19 
 
 
381 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  38.82 
 
 
342 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.29 
 
 
364 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1414  radical SAM enzyme, Cfr family  36 
 
 
361 aa  207  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>