61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0657 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0657  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 210 aa  435  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.872238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  68.37 
 
 		 202 aa  284  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  62.25 
 
 		 224 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  65.67 
 
 		 235 aa  271  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0944  hypothetical protein  64.18 
 
 		 262 aa  270  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3455  Radical SAM domain protein  62.38 
 
 		 235 aa  267  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3530  radical SAM domain-containing protein  61.9 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3649  radical SAM domain-containing protein  62.38 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  63.78 
 
 		 200 aa  266  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3339  radical SAM domain-containing protein  64.29 
 
 		 239 aa  265  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0787  radical SAM domain-containing protein  63.18 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3236  radical SAM domain-containing protein  63.18 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0837  radical SAM domain-containing protein  61.9 
 
 		 235 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2745  hypothetical protein  59.13 
 
 		 212 aa  259  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0889  radical SAM domain-containing protein  63.78 
 
 		 200 aa  259  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  43.08 
 
 		 459 aa  179  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  42.56 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  39.32 
 
 		 458 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  39.32 
 
 		 458 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  42.05 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  39.8 
 
 		 457 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  38.27 
 
 		 462 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  40.1 
 
 		 461 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  38.78 
 
 		 462 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  36.32 
 
 		 197 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  37.24 
 
 		 606 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.56 
 
 		 464 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  35.58 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  34.85 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  36.32 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  35.47 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  33.17 
 
 		 454 aa  114  8.999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  33.99 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  34.45 
 
 		 224 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 351 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 348 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 355 aa  45.1  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 450 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.05 
 
 		 349 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1799  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.29 
 
 		 391 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125674  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  30.33 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  26.06 
 
 		 342 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 451 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 565 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 351 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 437 aa  42.4  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49687  predicted protein  24.5 
 
 		 369 aa  42  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.622489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 390 aa  42  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  29.87 
 
 		 292 aa  41.6  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  29.87 
 
 		 292 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  29.87 
 
 		 292 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  29.87 
 
 		 292 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  29.87 
 
 		 292 aa  41.6  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  29.87 
 
 		 292 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  29.87 
 
 		 292 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  29.87 
 
 		 292 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  29.87 
 
 		 292 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  28.07 
 
 		 445 aa  41.2  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>