53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0877 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 210 aa  430  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  61.11 
 
 		 458 aa  252  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  60.21 
 
 		 457 aa  249  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  63.54 
 
 		 461 aa  249  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  59.09 
 
 		 458 aa  248  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  59.16 
 
 		 606 aa  242  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  61.78 
 
 		 462 aa  241  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  54.97 
 
 		 462 aa  225  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  50.76 
 
 		 464 aa  204  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  45.79 
 
 		 198 aa  184  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  45.69 
 
 		 200 aa  174  8e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  42.93 
 
 		 459 aa  161  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  39.9 
 
 		 197 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2745  hypothetical protein  45.6 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  44.04 
 
 		 200 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  45.45 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  43.88 
 
 		 224 aa  154  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  44.04 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  44.33 
 
 		 224 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0889  radical SAM domain-containing protein  46.35 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  44.44 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3236  radical SAM domain-containing protein  44.79 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0787  radical SAM domain-containing protein  44.79 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3339  radical SAM domain-containing protein  44.79 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0657  radical SAM domain-containing protein  42.56 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.872238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3455  Radical SAM domain protein  45.31 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3649  radical SAM domain-containing protein  45.31 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  45.31 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0837  radical SAM domain-containing protein  45.31 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3530  radical SAM domain-containing protein  44.79 
 
 		 235 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0944  hypothetical protein  44.79 
 
 		 262 aa  145  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  44.39 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  37.44 
 
 		 454 aa  139  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  39.71 
 
 		 215 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  42.86 
 
 		 206 aa  131  9e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  34.8 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47894  predicted protein  27.16 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29673  predicted protein  28.4 
 
 		 174 aa  51.6  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00157248 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27237  predicted protein  28.4 
 
 		 174 aa  51.6  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 		 351 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 355 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 338 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 351 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 287 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2288  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.67 
 
 		 375 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  29.79 
 
 		 348 aa  42.4  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  24.65 
 
 		 344 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5946  molybdopterin biosynthesis, protein A  27.41 
 
 		 331 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302426  normal  0.0104705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 427 aa  42  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  29.79 
 
 		 348 aa  41.6  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  29.79 
 
 		 348 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1947  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.43 
 
 		 329 aa  41.6  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.386779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>