255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4173 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 344 aa  722    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  39.26 
 
 		 337 aa  259  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  39.44 
 
 		 340 aa  243  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  40 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  35.87 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 359 aa  202  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  36.36 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  31.1 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  30.77 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  25.79 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  25.9 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 513 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  22.4 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  22.22 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.65 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  25.19 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  33.64 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  23.27 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  22.65 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  29.37 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  29.17 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  21.99 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  22.95 
 
 		 873 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  31.86 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  21.36 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  21.1 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  21.53 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.9 
 
 		 479 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.35 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  22.82 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.35 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.97 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  21.62 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  32.41 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 		 465 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20.2 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  28.15 
 
 		 461 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  20.43 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  22.71 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  22.71 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.22 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  22.71 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.54 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  24.22 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4827  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.85 
 
 		 382 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1849  Radical SAM domain protein  21.11 
 
 		 310 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  21.62 
 
 		 396 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  20.56 
 
 		 356 aa  53.1  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.81 
 
 		 334 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  24.49 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 		 427 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.9 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  34.23 
 
 		 404 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  18.84 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 450 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0683  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0710  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.09 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  26.62 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1506  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 496 aa  50.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 474 aa  50.4  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  29.06 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  23.94 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>