42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47894 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47894  predicted protein  100 
 
 
254 aa  523  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  32.89 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  29.3 
 
 
454 aa  65.9  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29673  predicted protein  29.2 
 
 
174 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00157248 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27237  predicted protein  29.2 
 
 
174 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  27.45 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 
225 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  28.74 
 
 
458 aa  62  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  28.16 
 
 
458 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  26.9 
 
 
457 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  24.39 
 
 
197 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  26.55 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  32.08 
 
 
459 aa  55.5  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 
224 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  26.32 
 
 
606 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  22.71 
 
 
462 aa  52  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  23.11 
 
 
464 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 
198 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  25.73 
 
 
462 aa  48.9  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.17 
 
 
340 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.69 
 
 
351 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  25.15 
 
 
461 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  37.5 
 
 
367 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0308  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.35 
 
 
328 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.85 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.47 
 
 
348 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.83 
 
 
329 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0399  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.04 
 
 
337 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245923  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.04 
 
 
337 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  35 
 
 
680 aa  42.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.04 
 
 
308 aa  42.7  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15625  predicted protein  29.59 
 
 
335 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.63 
 
 
339 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 
202 aa  43.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 
200 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1233  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.35 
 
 
365 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.22 
 
 
323 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>