95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1325 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  100 
 
 
244 aa  480  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  91.96 
 
 
224 aa  380  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  92.02 
 
 
213 aa  360  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  76.64 
 
 
225 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  47.06 
 
 
464 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  47.5 
 
 
462 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  46.57 
 
 
461 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  46.5 
 
 
457 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  45.5 
 
 
606 aa  168  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  45.45 
 
 
210 aa  166  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  45.5 
 
 
458 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  46 
 
 
458 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  41.7 
 
 
462 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  45.32 
 
 
459 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
198 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  40.98 
 
 
202 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2745  hypothetical protein  40 
 
 
212 aa  141  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  41.03 
 
 
206 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 
200 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  37.69 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  38.76 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0889  radical SAM domain-containing protein  38.31 
 
 
200 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  35 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  39.49 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0657  radical SAM domain-containing protein  34.98 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.872238  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  33.98 
 
 
454 aa  125  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3455  Radical SAM domain protein  35.85 
 
 
235 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3530  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0837  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  34.43 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3649  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0944  hypothetical protein  35.82 
 
 
262 aa  119  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3339  radical SAM domain-containing protein  36.02 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3236  radical SAM domain-containing protein  36.41 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0787  radical SAM domain-containing protein  36.41 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47894  predicted protein  26.55 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.75 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  31.78 
 
 
355 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.745253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.1 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16031  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  32.5 
 
 
356 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  33.33 
 
 
361 aa  48.9  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29673  predicted protein  31.41 
 
 
174 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00157248 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27237  predicted protein  31.41 
 
 
174 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49687  predicted protein  32.82 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.622489 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  29.34 
 
 
351 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.85 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  30.23 
 
 
356 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  32.03 
 
 
367 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  34.34 
 
 
368 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 
446 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0726  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.38 
 
 
383 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0372  radical SAM protein  33.09 
 
 
355 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.187269 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.74 
 
 
351 aa  46.6  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.03 
 
 
326 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1282  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.41 
 
 
327 aa  45.8  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.591085  normal  0.574415 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  31.11 
 
 
356 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.53 
 
 
333 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.16 
 
 
337 aa  45.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  29.55 
 
 
373 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0016411  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 
415 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.03 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 
351 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1198  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  32.37 
 
 
365 aa  43.9  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.347563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0823  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.06 
 
 
342 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0317783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.12 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2269  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.26 
 
 
345 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.32 
 
 
389 aa  43.5  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  32.21 
 
 
344 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15625  predicted protein  24.83 
 
 
335 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
342 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 
355 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  29.11 
 
 
375 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.81 
 
 
317 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20010  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.56 
 
 
338 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0117672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4135  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.86 
 
 
326 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0152666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.72 
 
 
325 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 
317 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004351  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  29.11 
 
 
375 aa  42.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2818  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.82 
 
 
326 aa  42.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 
332 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1952  Radical SAM domain protein  29.59 
 
 
481 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000720024  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03880  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.97 
 
 
337 aa  42.4  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  31.29 
 
 
368 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  41.79 
 
 
841 aa  42.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18821  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  31.06 
 
 
359 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.36 
 
 
328 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  29.71 
 
 
380 aa  42  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.39 
 
 
329 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3745  radical SAM enzyme, Cfr family  30.88 
 
 
329 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  decreased coverage  0.00432991 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.02 
 
 
323 aa  42  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  34.33 
 
 
334 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  30.6 
 
 
392 aa  41.6  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2288  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.44 
 
 
375 aa  42  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.04 
 
 
395 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>