More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0372 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0372  radical SAM protein  100 
 
 		 355 aa  709    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187269 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.29 
 
 		 343 aa  243  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.29 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.21 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  42.07 
 
 		 344 aa  236  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  42.3 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  39.08 
 
 		 371 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  37.75 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  41.35 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  40.79 
 
 		 388 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  46.69 
 
 		 376 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.19 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.24 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  41.31 
 
 		 374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.01 
 
 		 344 aa  226  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  40.45 
 
 		 383 aa  225  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  40.45 
 
 		 374 aa  225  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3677  radical SAM enzyme, Cfr family  40.62 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.09 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.71 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.09 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.67 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.59 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  40.5 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.78 
 
 		 380 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  41.76 
 
 		 388 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  38.38 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.06 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  43.81 
 
 		 364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.34 
 
 		 362 aa  223  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.34 
 
 		 362 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.34 
 
 		 362 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.34 
 
 		 362 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.34 
 
 		 362 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.34 
 
 		 362 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.19 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2700  radical SAM protein  39.39 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.06 
 
 		 362 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.81 
 
 		 354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  39.22 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  39.49 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0083  radical SAM protein  40.96 
 
 		 391 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.82 
 
 		 380 aa  219  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.06 
 
 		 362 aa  219  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.21 
 
 		 358 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  44.14 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.85 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.24 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.77 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  40.85 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3745  radical SAM enzyme, Cfr family  41.57 
 
 		 329 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  decreased coverage  0.00432991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.1 
 
 		 372 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  38.59 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  37.54 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  38.33 
 
 		 392 aa  216  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  38.11 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  36.9 
 
 		 351 aa  216  5e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0085  radical SAM enzyme, Cfr family  37.99 
 
 		 404 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1539  radical SAM protein  37.82 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.177286  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  46.37 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.17 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  41.05 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16851  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.45 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  42.49 
 
 		 354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  42.39 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  40.11 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.18 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  41.34 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.06 
 
 		 341 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  41.34 
 
 		 382 aa  212  7e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  40.21 
 
 		 356 aa  212  7e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  36.24 
 
 		 342 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2502  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.2 
 
 		 383 aa  212  9e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293735  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.18 
 
 		 361 aa  212  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  35.6 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1657  radical SAM enzyme, Cfr family  39.31 
 
 		 401 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33058  normal  0.466299 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_3052  predicted protein  37.9 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3237  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.6 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  42.86 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  41.4 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1000  radical SAM enzyme, Cfr family  39.44 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189733  normal  0.570497 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  35.06 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1489  radical SAM enzyme, Cfr family  38.38 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  38.11 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.36 
 
 		 346 aa  209  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  40.34 
 
 		 345 aa  209  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.9 
 
 		 373 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.17 
 
 		 347 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16031  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.36 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.1 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3612  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.78 
 
 		 398 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16611  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.02 
 
 		 348 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.785393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  32.95 
 
 		 340 aa  209  7e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.48 
 
 		 365 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.11 
 
 		 364 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  39.22 
 
 		 371 aa  209  8e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2357  radical SAM protein  39.04 
 
 		 378 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  39.04 
 
 		 378 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1109  radical SAM protein  39.04 
 
 		 378 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>