More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1503 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 		 340 aa  691    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  70.59 
 
 		 348 aa  506  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.88 
 
 		 343 aa  471  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.59 
 
 		 343 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.41 
 
 		 347 aa  388  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1388  radical SAM enzyme, Cfr family  50 
 
 		 462 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  46.65 
 
 		 349 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.07 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  47.09 
 
 		 348 aa  292  5e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.57 
 
 		 342 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.99 
 
 		 347 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.99 
 
 		 347 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.76 
 
 		 349 aa  281  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2012  radical SAM enzyme, Cfr family  45 
 
 		 357 aa  278  9e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  45.48 
 
 		 357 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  43.98 
 
 		 356 aa  273  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  39.4 
 
 		 349 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.64 
 
 		 364 aa  272  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.64 
 
 		 364 aa  272  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.07 
 
 		 381 aa  271  8.000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  42.99 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  42.57 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0426  radical SAM enzyme, Cfr family  42.31 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.09 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.71 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.4 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.24 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.24 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.76 
 
 		 355 aa  265  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.25 
 
 		 355 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  42.6 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.24 
 
 		 340 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  40.18 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  43.81 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.09 
 
 		 351 aa  263  4e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0596  radical SAM enzyme, Cfr family  43.24 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  41.76 
 
 		 391 aa  263  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.88 
 
 		 341 aa  262  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  40.94 
 
 		 350 aa  262  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.81 
 
 		 365 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  41.96 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0665  radical SAM enzyme, Cfr family  42.61 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.11 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.38 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  39.41 
 
 		 367 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  41.94 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  41.23 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  41.62 
 
 		 376 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.38 
 
 		 368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  42.98 
 
 		 371 aa  258  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0269  hypothetical protein  40.24 
 
 		 410 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  40.36 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 398 aa  255  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  39.22 
 
 		 358 aa  255  9e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.25 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  41.62 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.37 
 
 		 371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  41.69 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  41.62 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.99 
 
 		 354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.428537  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.9 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2624  radical SAM enzyme, Cfr family  41.89 
 
 		 342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.07 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0951  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.16 
 
 		 361 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.55 
 
 		 351 aa  252  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.02 
 
 		 346 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  39.53 
 
 		 381 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0041  radical SAM protein  40.34 
 
 		 392 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  42.02 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1905  radical SAM protein  39.89 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  41.33 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  38.95 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2311  radical SAM protein  41.42 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4986  radical SAM enzyme, Cfr family  41.11 
 
 		 349 aa  250  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.323052  hitchhiker  0.00454129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  40.77 
 
 		 342 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  38.66 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.35 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.06 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  39.24 
 
 		 381 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.06 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.06 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.06 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.06 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.06 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.06 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  39.24 
 
 		 381 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  39.72 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1382  radical SAM superfamily protein  40.34 
 
 		 392 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0050  radical SAM protein  40.34 
 
 		 392 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.890909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  39.24 
 
 		 381 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.06 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.74 
 
 		 351 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.13 
 
 		 356 aa  249  6e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  38.08 
 
 		 379 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  38.66 
 
 		 382 aa  248  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40320  hypothetical protein  37.5 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666991  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  40.98 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  38.95 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.65 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  39.04 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>