More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0409 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 		 389 aa  810    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  61.17 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23560  radical SAM enzyme, Cfr family  60.5 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1009  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.38 
 
 		 376 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.834278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2502  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.96 
 
 		 383 aa  450  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293735  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.56 
 
 		 395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1489  radical SAM enzyme, Cfr family  58.71 
 
 		 375 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3237  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.66 
 
 		 376 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21300  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.91 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.830404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1420  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.58 
 
 		 391 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0340942  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60 
 
 		 365 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1000  radical SAM enzyme, Cfr family  56.33 
 
 		 388 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189733  normal  0.570497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  59.15 
 
 		 388 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  58.82 
 
 		 374 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  57.62 
 
 		 368 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3677  radical SAM enzyme, Cfr family  60.5 
 
 		 365 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1185  radical SAM enzyme, Cfr family  57.07 
 
 		 389 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  56.39 
 
 		 371 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  58.99 
 
 		 372 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11240  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.89 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.43214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09960  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.59 
 
 		 370 aa  408  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.434962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.1 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4121  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.6 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1987  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.04 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0876088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  54.4 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2006  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.04 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578114  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12894  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.44 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.942196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2052  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.04 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  52.39 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.54 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  52.92 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3980  radical SAM enzyme, Cfr family  55.68 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  52.1 
 
 		 380 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1166  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.42 
 
 		 385 aa  355  7.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800858  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.78 
 
 		 361 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.14 
 
 		 363 aa  276  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  44.38 
 
 		 353 aa  268  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  43.93 
 
 		 408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  43.77 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.83 
 
 		 399 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.52 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  42.77 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  41.21 
 
 		 349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  40.35 
 
 		 344 aa  248  9e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  40.79 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  40.28 
 
 		 371 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.44 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_3052  predicted protein  41.31 
 
 		 378 aa  246  6.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  40.95 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  39.58 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  40.3 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  41.96 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  37.89 
 
 		 351 aa  243  6e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  40 
 
 		 356 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  41.76 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.54 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.36 
 
 		 365 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  39.21 
 
 		 342 aa  239  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  40.27 
 
 		 359 aa  239  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  37.97 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1461  radical SAM protein  40.88 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0453987  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.18 
 
 		 343 aa  238  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  42.81 
 
 		 382 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1752  radical SAM protein  40.44 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1725  radical SAM protein  40.44 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  39.94 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  42.77 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1347  radical SAM protein  40 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.5 
 
 		 343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2357  radical SAM protein  40 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1838  radical SAM protein  40.17 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1109  radical SAM protein  40 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545154  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.13 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  40.17 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  40 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2230  radical SAM protein  40 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1814  radical SAM protein  40.17 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2192  radical SAM protein  40 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1837  radical SAM protein  40 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  38.79 
 
 		 357 aa  236  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5115  hypothetical protein  40.17 
 
 		 379 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.92 
 
 		 364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1592  hypothetical protein  38.74 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.4 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2543  radical SAM enzyme, Cfr family  38.74 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180565  hitchhiker  0.00648935 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.76 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.89 
 
 		 342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.76 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.64 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2232  radical SAM protein  40.17 
 
 		 378 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1422  radical SAM protein  38.96 
 
 		 382 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12366  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  41.39 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  40 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.34 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  40.28 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  39.5 
 
 		 384 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  41.39 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.24 
 
 		 344 aa  232  8.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>