More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4057 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 342 aa  702    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.31 
 
 		 360 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.26 
 
 		 343 aa  358  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.6 
 
 		 346 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.55 
 
 		 351 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.51 
 
 		 351 aa  352  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.96 
 
 		 351 aa  348  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.94 
 
 		 371 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.74 
 
 		 347 aa  347  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2311  radical SAM protein  46.61 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  44.89 
 
 		 358 aa  322  6e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  47.34 
 
 		 349 aa  318  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  47.66 
 
 		 372 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.78 
 
 		 354 aa  316  3e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.428537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  46.04 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  47.66 
 
 		 372 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  47.66 
 
 		 372 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  44.06 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  45.56 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  47.38 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.67 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  43.77 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.45 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.73 
 
 		 356 aa  309  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  43.91 
 
 		 402 aa  308  8e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.38 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2087  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.44 
 
 		 356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122222  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.8 
 
 		 358 aa  305  6e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  45.06 
 
 		 373 aa  305  7e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  45.64 
 
 		 377 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  44.48 
 
 		 382 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.18 
 
 		 354 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  45.81 
 
 		 369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  45.48 
 
 		 376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0083  radical SAM protein  45.4 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  46.31 
 
 		 359 aa  302  6.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  44.64 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  44.64 
 
 		 374 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  43.6 
 
 		 382 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  43.84 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  44.16 
 
 		 372 aa  299  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  44.64 
 
 		 397 aa  299  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  44.57 
 
 		 370 aa  298  7e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  44.57 
 
 		 370 aa  298  7e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.09 
 
 		 381 aa  298  7e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  44.82 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  43.86 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  44.44 
 
 		 365 aa  296  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  43.49 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0663  radical SAM enzyme, Cfr family  43.9 
 
 		 383 aa  296  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0103846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1657  radical SAM enzyme, Cfr family  44.81 
 
 		 401 aa  295  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33058  normal  0.466299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  43.27 
 
 		 383 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  43.27 
 
 		 383 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  44.93 
 
 		 394 aa  295  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1930  radical SAM enzyme, Cfr family  48.17 
 
 		 362 aa  295  9e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1602  radical SAM enzyme, Cfr family  48.17 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.113295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  43.49 
 
 		 371 aa  294  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  43.53 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  45.67 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  43.06 
 
 		 384 aa  292  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2806  hypothetical protein  45.69 
 
 		 427 aa  292  7e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  45.77 
 
 		 428 aa  291  9e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  42.65 
 
 		 382 aa  291  9e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3626  hypothetical protein  45.69 
 
 		 397 aa  291  9e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  47.04 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.48 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  42.77 
 
 		 384 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1780  hypothetical protein  45.05 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  46.96 
 
 		 425 aa  289  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  43.82 
 
 		 375 aa  289  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.31 
 
 		 342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  41.23 
 
 		 382 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3089  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.54 
 
 		 360 aa  288  6e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.929572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01053  radical SAM enzyme, Cfr family  44.81 
 
 		 393 aa  289  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184624  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06113  radical SAM enzyme, Cfr family  44.81 
 
 		 393 aa  289  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245547  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  48.35 
 
 		 354 aa  288  7e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  41.59 
 
 		 382 aa  288  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  45.4 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  46.41 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1716  radical SAM protein  44.74 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973881  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.7 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.6 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.94 
 
 		 380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  45.11 
 
 		 399 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2093  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.45 
 
 		 356 aa  285  7e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  46.31 
 
 		 403 aa  285  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4255  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.06 
 
 		 386 aa  285  9e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1640  radical SAM protein  46.38 
 
 		 425 aa  285  9e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  41 
 
 		 381 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  41 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  41 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.31 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  46.38 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.4 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.89 
 
 		 361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.68 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  43.81 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  44.54 
 
 		 399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0028  radical SAM protein  46.53 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>