More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2804 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 
355 aa  732    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  81.87 
 
 
356 aa  597  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  76.36 
 
 
345 aa  544  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  72.09 
 
 
367 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  69.86 
 
 
355 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  73.25 
 
 
340 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  73.25 
 
 
340 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.29 
 
 
361 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.02 
 
 
351 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.35 
 
 
351 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16031  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.23 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  58.75 
 
 
356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18821  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.14 
 
 
359 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1012  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.84 
 
 
359 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12087  predicted protein  56.97 
 
 
340 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.67 
 
 
347 aa  348  6e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16851  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.67 
 
 
348 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1574  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.49 
 
 
348 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16611  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.97 
 
 
348 aa  338  8e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.785393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  44.84 
 
 
349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49687  predicted protein  45.8 
 
 
369 aa  295  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.622489 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.84 
 
 
362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.9 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.9 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.84 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.9 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.9 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.9 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.9 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.9 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  43.71 
 
 
348 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.64 
 
 
362 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.15 
 
 
343 aa  279  5e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.78 
 
 
362 aa  279  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.56 
 
 
343 aa  278  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  42.86 
 
 
356 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.14 
 
 
349 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.26 
 
 
368 aa  276  5e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  44.97 
 
 
351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  42.73 
 
 
349 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.41 
 
 
389 aa  273  3e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  47.1 
 
 
318 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3115  radical SAM enzyme, Cfr family  43.5 
 
 
353 aa  272  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248396  hitchhiker  0.0000000842526 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  43.7 
 
 
377 aa  272  7e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  44.68 
 
 
360 aa  271  8.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.9 
 
 
342 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  43.37 
 
 
408 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.04 
 
 
347 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.04 
 
 
347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  44.68 
 
 
342 aa  269  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  42.55 
 
 
350 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.89 
 
 
364 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.89 
 
 
364 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.19 
 
 
349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.76 
 
 
340 aa  265  8e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.96 
 
 
359 aa  264  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  42.12 
 
 
344 aa  263  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.36 
 
 
341 aa  263  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3124  hypothetical protein  38.7 
 
 
365 aa  263  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  40.46 
 
 
357 aa  262  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.46 
 
 
365 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.76 
 
 
364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  43.36 
 
 
342 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  40.12 
 
 
369 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14130  radical SAM enzyme, Cfr family  41.67 
 
 
351 aa  257  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.05 
 
 
364 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  40.88 
 
 
382 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 
367 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  40.29 
 
 
381 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  40.35 
 
 
351 aa  256  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.2 
 
 
344 aa  256  6e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  40 
 
 
382 aa  255  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  40 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  42.65 
 
 
392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  38.7 
 
 
372 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  42.56 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  39.71 
 
 
381 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.7 
 
 
386 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  39.71 
 
 
381 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  39.71 
 
 
381 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  42.21 
 
 
376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  41.03 
 
 
372 aa  253  5.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  43.9 
 
 
364 aa  252  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  40.29 
 
 
382 aa  252  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  38.53 
 
 
350 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  43.35 
 
 
344 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0188  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.17 
 
 
365 aa  250  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  40.54 
 
 
359 aa  249  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  42.04 
 
 
366 aa  249  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.12 
 
 
364 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  43.24 
 
 
353 aa  247  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3855  radical SAM enzyme, Cfr family  39.32 
 
 
348 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.74079  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  40.17 
 
 
375 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  38.62 
 
 
391 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  38.76 
 
 
364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.18 
 
 
347 aa  245  6.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  39.77 
 
 
371 aa  245  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  38.94 
 
 
402 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  42.56 
 
 
354 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  39 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>