More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3237 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3237  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 		 376 aa  763    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  73.83 
 
 		 388 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  74.25 
 
 		 374 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  73.28 
 
 		 395 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1000  radical SAM enzyme, Cfr family  74.66 
 
 		 388 aa  528  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189733  normal  0.570497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3677  radical SAM enzyme, Cfr family  69.59 
 
 		 365 aa  504  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23560  radical SAM enzyme, Cfr family  69.81 
 
 		 364 aa  501  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1489  radical SAM enzyme, Cfr family  70.11 
 
 		 375 aa  501  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  68.58 
 
 		 365 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1420  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  69.7 
 
 		 391 aa  500  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0340942  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2502  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  69.04 
 
 		 383 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293735  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1009  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.94 
 
 		 376 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.834278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  66.22 
 
 		 371 aa  487  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  66.76 
 
 		 368 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21300  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  63.71 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.830404  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  65.95 
 
 		 368 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09960  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.95 
 
 		 370 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.434962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11240  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60 
 
 		 426 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.43214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  64.75 
 
 		 388 aa  458  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.85 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.85 
 
 		 372 aa  460  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1185  radical SAM enzyme, Cfr family  64.44 
 
 		 389 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.68 
 
 		 380 aa  455  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4121  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.21 
 
 		 365 aa  455  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  66.67 
 
 		 353 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.48 
 
 		 365 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3980  radical SAM enzyme, Cfr family  67.48 
 
 		 395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.92 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.43 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2006  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.69 
 
 		 374 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578114  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1987  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.69 
 
 		 374 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0876088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2052  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.69 
 
 		 374 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.66 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1166  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  66.67 
 
 		 385 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800858  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12894  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.74 
 
 		 364 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.942196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.9 
 
 		 363 aa  302  7.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.05 
 
 		 399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.39 
 
 		 399 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  45.03 
 
 		 408 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  45.01 
 
 		 354 aa  266  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  46.55 
 
 		 353 aa  263  3e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  42.66 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.46 
 
 		 343 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  40.46 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  40.52 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.03 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  41.39 
 
 		 344 aa  249  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  40.97 
 
 		 357 aa  249  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  40.65 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.89 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  41.3 
 
 		 350 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  42.19 
 
 		 397 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.68 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  42.86 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  40 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  37.95 
 
 		 348 aa  239  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  42.15 
 
 		 360 aa  239  6.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  38.62 
 
 		 349 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  37.64 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  40.51 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.5 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.28 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.92 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.72 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.8 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.8 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.8 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.8 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.8 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.8 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1388  radical SAM enzyme, Cfr family  41.09 
 
 		 462 aa  235  8e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.57 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.8 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.63 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0665  radical SAM enzyme, Cfr family  37.06 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.08 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.52 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  41.24 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  42.9 
 
 		 374 aa  233  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  42.9 
 
 		 383 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0444  hypothetical protein  40.06 
 
 		 355 aa  232  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  42.39 
 
 		 393 aa  232  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  44.95 
 
 		 318 aa  232  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.29 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  41.97 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  42.25 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1838  radical SAM protein  42.25 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1814  radical SAM protein  42.25 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  41.26 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  41.42 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  40.46 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1725  radical SAM protein  42.25 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5115  hypothetical protein  42.25 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.76 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1752  radical SAM protein  42.25 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  40.73 
 
 		 382 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0834  radical SAM protein  40.31 
 
 		 428 aa  229  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>