More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2993 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  100 
 
 
356 aa  732    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  52.91 
 
 
398 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  52.91 
 
 
399 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  52.51 
 
 
399 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  52.63 
 
 
403 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  51.74 
 
 
428 aa  364  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  52.63 
 
 
399 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3626  hypothetical protein  51.12 
 
 
397 aa  360  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3068  radical SAM protein  52.79 
 
 
413 aa  359  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1640  radical SAM protein  50.68 
 
 
425 aa  358  9e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0041  radical SAM protein  50.14 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  50.41 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2859  radical SAM protein  51.79 
 
 
408 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  50.41 
 
 
425 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2806  hypothetical protein  52.68 
 
 
427 aa  355  5e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1382  radical SAM superfamily protein  49.58 
 
 
392 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0085  radical SAM enzyme, Cfr family  51.16 
 
 
404 aa  355  8.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0050  radical SAM protein  49.58 
 
 
392 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.890909  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0269  hypothetical protein  48.88 
 
 
410 aa  354  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  49.58 
 
 
391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2700  radical SAM protein  50.28 
 
 
390 aa  353  4e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3014  hypothetical protein  47.91 
 
 
397 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  50.3 
 
 
406 aa  350  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2962  radical SAM protein  49.72 
 
 
402 aa  349  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3724  radical SAM enzyme, Cfr family  50.14 
 
 
408 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4168  Fe-S-cluster redox protein  50.14 
 
 
410 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1122  radical SAM protein  49.73 
 
 
430 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0398  radical SAM protein  49.32 
 
 
414 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0578367  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4047  radical SAM enzyme, Cfr family  49.86 
 
 
409 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  49.86 
 
 
376 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0076  hypothetical protein  50.84 
 
 
411 aa  345  7e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  50.56 
 
 
404 aa  345  8.999999999999999e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2966  radical SAM enzyme, Cfr family  49.86 
 
 
399 aa  344  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.80573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0090  radical SAM protein  49.59 
 
 
411 aa  343  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1436  hypothetical protein  46.93 
 
 
429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0077  hypothetical protein  50.56 
 
 
411 aa  342  7e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1380  radical SAM protein  51.79 
 
 
399 aa  342  7e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0759  radical SAM protein  48.66 
 
 
391 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.88 
 
 
373 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0888845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.16 
 
 
373 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.6 
 
 
373 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.6 
 
 
373 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  48.57 
 
 
362 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  48.6 
 
 
364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1362  radical SAM protein  51.03 
 
 
414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3612  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.41 
 
 
398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4556  radical SAM protein  47.58 
 
 
431 aa  335  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15006  decreased coverage  0.00152892 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.92 
 
 
373 aa  335  7e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.32 
 
 
373 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.32 
 
 
373 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.77 
 
 
373 aa  334  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1725  radical SAM protein  50 
 
 
379 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.77 
 
 
373 aa  334  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1838  radical SAM protein  50 
 
 
379 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  50 
 
 
379 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 
388 aa  334  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1752  radical SAM protein  50 
 
 
379 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1814  radical SAM protein  50 
 
 
379 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02409  predicted enzyme  49.57 
 
 
384 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1151  radical SAM enzyme, Cfr family  49.57 
 
 
384 aa  333  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.390398  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.57 
 
 
384 aa  333  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1422  radical SAM protein  48.48 
 
 
382 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12366  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.92 
 
 
373 aa  334  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5115  hypothetical protein  50.3 
 
 
379 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159423  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2669  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.57 
 
 
384 aa  333  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02371  hypothetical protein  49.57 
 
 
384 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1160  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.57 
 
 
384 aa  333  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0206768 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.92 
 
 
373 aa  333  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2801  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.57 
 
 
384 aa  333  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  47.69 
 
 
369 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  50 
 
 
384 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0028  radical SAM protein  48.45 
 
 
396 aa  333  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.77 
 
 
373 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  48.62 
 
 
365 aa  332  4e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0703  hypothetical protein  45.36 
 
 
420 aa  333  4e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.42 
 
 
372 aa  332  5e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2895  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 
388 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2783  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 
388 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.355164  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2720  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 
388 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.564025  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2764  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 
388 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2677  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 
388 aa  332  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2543  radical SAM enzyme, Cfr family  48.2 
 
 
383 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180565  hitchhiker  0.00648935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1461  radical SAM protein  50 
 
 
378 aa  332  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0453987  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.77 
 
 
373 aa  331  9e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3742  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 
384 aa  331  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1592  hypothetical protein  48.2 
 
 
383 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  48.18 
 
 
375 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  49.57 
 
 
384 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0421  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48 
 
 
398 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.662236  hitchhiker  0.00298691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4488  radical SAM enzyme, Cfr family  46.51 
 
 
431 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1429  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.49 
 
 
373 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0876618 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1290  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48 
 
 
398 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1183  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48 
 
 
398 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2668  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 
384 aa  330  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1602  radical SAM enzyme, Cfr family  51.16 
 
 
363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.113295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1930  radical SAM enzyme, Cfr family  51.16 
 
 
362 aa  328  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  49.42 
 
 
360 aa  328  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1109  radical SAM protein  48.17 
 
 
378 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545154  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2357  radical SAM protein  48.17 
 
 
378 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.93 
 
 
373 aa  328  8e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>