More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_3052 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_3052  predicted protein  100 
 
 
378 aa  785    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.49 
 
 
399 aa  276  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0834  radical SAM protein  43.92 
 
 
428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0281827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.05 
 
 
349 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  44.05 
 
 
354 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.91 
 
 
399 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.78 
 
 
361 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  42.31 
 
 
349 aa  262  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.26 
 
 
349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.48 
 
 
363 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  40.37 
 
 
377 aa  252  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  42.69 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.96 
 
 
395 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  41.69 
 
 
374 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  42.78 
 
 
388 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.98 
 
 
372 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.57 
 
 
364 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.61 
 
 
429 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21300  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.3 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.830404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.48 
 
 
365 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  41.45 
 
 
344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.31 
 
 
389 aa  243  5e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  41.83 
 
 
371 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.86 
 
 
365 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  40.23 
 
 
382 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0679  hypothetical protein  37.31 
 
 
409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3677  radical SAM enzyme, Cfr family  43.71 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  41.73 
 
 
371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  39.57 
 
 
366 aa  239  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.45 
 
 
365 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  41.26 
 
 
373 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.97 
 
 
421 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3745  radical SAM enzyme, Cfr family  40.87 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  decreased coverage  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  42.9 
 
 
360 aa  239  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  38.98 
 
 
367 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  38.9 
 
 
372 aa  239  8e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  38.46 
 
 
382 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0648  hypothetical protein  36.79 
 
 
413 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1420  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.94 
 
 
391 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0340942  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  38.96 
 
 
370 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.01 
 
 
361 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  42.61 
 
 
368 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  38.96 
 
 
370 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4121  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.17 
 
 
365 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  38.46 
 
 
382 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.5 
 
 
342 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  38.81 
 
 
351 aa  236  4e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  39.73 
 
 
357 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  37.16 
 
 
348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09960  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.02 
 
 
370 aa  235  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.434962  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  39.07 
 
 
372 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  39.19 
 
 
375 aa  235  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  38.87 
 
 
364 aa  235  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  40.4 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  40.4 
 
 
374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.22 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1489  radical SAM enzyme, Cfr family  40.93 
 
 
375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.22 
 
 
368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3855  radical SAM enzyme, Cfr family  37.16 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.74079  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  39.78 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  37.54 
 
 
350 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  39.07 
 
 
372 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  39.94 
 
 
397 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  39.95 
 
 
378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1905  radical SAM protein  37.77 
 
 
403 aa  233  5e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11240  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40 
 
 
426 aa  233  6e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.43214  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  40.11 
 
 
393 aa  233  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.11 
 
 
362 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.66 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.66 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.66 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.66 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.66 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.66 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.66 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  37.64 
 
 
349 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.66 
 
 
362 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  39.71 
 
 
394 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1009  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.29 
 
 
376 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.834278 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.87 
 
 
373 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.17 
 
 
364 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  39.78 
 
 
350 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  38.11 
 
 
382 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2006  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.61 
 
 
374 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578114  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1987  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.61 
 
 
374 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0876088  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23560  radical SAM enzyme, Cfr family  42.45 
 
 
364 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2052  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.61 
 
 
374 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  38.52 
 
 
372 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  40.11 
 
 
382 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  38.96 
 
 
360 aa  230  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  40.92 
 
 
342 aa  230  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  39.31 
 
 
382 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.69 
 
 
343 aa  229  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3237  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.14 
 
 
376 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.4 
 
 
340 aa  229  7e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  39.54 
 
 
382 aa  229  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  40.55 
 
 
377 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.38 
 
 
362 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.59 
 
 
343 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0483  radical SAM enzyme, Cfr family  38.9 
 
 
350 aa  228  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0926837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>