More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16031 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_16031  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 		 356 aa  730    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  71.14 
 
 		 351 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  69.5 
 
 		 351 aa  500  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  67.71 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18821  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  66.36 
 
 		 359 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1012  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.76 
 
 		 359 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.23 
 
 		 355 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  58.46 
 
 		 367 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.57 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  58.75 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  58.16 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.99 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  56.45 
 
 		 345 aa  398  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  58.46 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1574  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  52.65 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16611  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.24 
 
 		 348 aa  374  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.785393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16851  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.53 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12087  predicted protein  51.98 
 
 		 340 aa  332  4e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49687  predicted protein  47.86 
 
 		 369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.622489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  45.81 
 
 		 349 aa  293  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  43.02 
 
 		 369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  42.44 
 
 		 349 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.6 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.12 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  40.44 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  44.18 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.55 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.12 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.12 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.12 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.12 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.12 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.12 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.12 
 
 		 362 aa  262  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.58 
 
 		 367 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  42.27 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.83 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.65 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  45.28 
 
 		 318 aa  260  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  40.35 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  41.87 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 398 aa  259  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.94 
 
 		 365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.55 
 
 		 362 aa  258  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  40.23 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  42.2 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  42.55 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  41.69 
 
 		 360 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.18 
 
 		 341 aa  256  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  40.57 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.23 
 
 		 373 aa  255  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  39.71 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.72 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.31 
 
 		 386 aa  252  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.38 
 
 		 373 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  40.51 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  40.28 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.94 
 
 		 373 aa  249  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4255  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.46 
 
 		 386 aa  249  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  39.94 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 		 380 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  40.77 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  39.94 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.59 
 
 		 354 aa  249  5e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  40.29 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.87 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07736  hypothetical protein  41.21 
 
 		 346 aa  249  6e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.94 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  39.66 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  39.66 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.23 
 
 		 356 aa  248  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.81 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.53 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  39.66 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  40.23 
 
 		 382 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  40.17 
 
 		 384 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004351  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.94 
 
 		 375 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  39.83 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4182  radical SAM protein  41.83 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  39.83 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  39.83 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.66 
 
 		 373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.81 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.94 
 
 		 356 aa  245  6.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.71 
 
 		 349 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  42.39 
 
 		 348 aa  245  9e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  39.27 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.53 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.23 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.66 
 
 		 373 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.53 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  40.92 
 
 		 357 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.53 
 
 		 373 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  42.73 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  39.04 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.24 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3124  hypothetical protein  38.14 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.53 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>