More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1743 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 
358 aa  733    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  74.86 
 
 
381 aa  546  1e-154  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.8 
 
 
356 aa  533  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  71.67 
 
 
371 aa  529  1e-149  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  71.71 
 
 
354 aa  528  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2087  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  70.89 
 
 
356 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122222  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  71.76 
 
 
356 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  70.61 
 
 
356 aa  501  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  66.67 
 
 
358 aa  501  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2093  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.4 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.58 
 
 
371 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  45.8 
 
 
342 aa  305  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  46.73 
 
 
349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.06 
 
 
360 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.27 
 
 
343 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.91 
 
 
346 aa  298  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  44.18 
 
 
378 aa  296  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2311  radical SAM protein  46.65 
 
 
371 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.87 
 
 
347 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.55 
 
 
386 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.6 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  42.7 
 
 
428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.58 
 
 
351 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  42.58 
 
 
391 aa  281  9e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.58 
 
 
351 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.16 
 
 
359 aa  279  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.89 
 
 
367 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.8 
 
 
364 aa  275  6e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0085  radical SAM enzyme, Cfr family  41.11 
 
 
404 aa  275  7e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0028  radical SAM protein  43.02 
 
 
396 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2700  radical SAM protein  41.39 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.5 
 
 
341 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.11 
 
 
365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  42.01 
 
 
399 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  41.82 
 
 
399 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  43.87 
 
 
371 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  41.02 
 
 
399 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1382  radical SAM superfamily protein  41.43 
 
 
392 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0041  radical SAM protein  41.14 
 
 
392 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0050  radical SAM protein  41.43 
 
 
392 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.890909  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  42.69 
 
 
403 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.49 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.49 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.49 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.49 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.49 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.49 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.49 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  43.14 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1380  radical SAM protein  42.45 
 
 
399 aa  270  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  40.75 
 
 
398 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  41.93 
 
 
377 aa  270  4e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.93 
 
 
364 aa  268  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.46 
 
 
362 aa  269  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  41.47 
 
 
372 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.2 
 
 
362 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  41.52 
 
 
364 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.62 
 
 
362 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.26 
 
 
354 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.428537  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  41.18 
 
 
372 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3626  hypothetical protein  42.41 
 
 
397 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  41.47 
 
 
372 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.2 
 
 
362 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1567  hypothetical protein  41.69 
 
 
346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00430195  hitchhiker  0.00703244 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.29 
 
 
344 aa  267  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  41.48 
 
 
377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2806  hypothetical protein  40.21 
 
 
427 aa  266  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  42.33 
 
 
339 aa  266  4e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  41.81 
 
 
382 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  41.13 
 
 
357 aa  265  7e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  41.81 
 
 
382 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  41.03 
 
 
406 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.06 
 
 
358 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  39.53 
 
 
359 aa  264  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.66 
 
 
348 aa  263  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0076  hypothetical protein  42.61 
 
 
411 aa  263  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  38.67 
 
 
373 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3089  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.27 
 
 
360 aa  262  8e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.929572  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  42.32 
 
 
376 aa  262  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0090  radical SAM protein  41.22 
 
 
411 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.11 
 
 
340 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  39.72 
 
 
404 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.85 
 
 
343 aa  261  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0077  hypothetical protein  42.33 
 
 
411 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  39.72 
 
 
382 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  39.84 
 
 
372 aa  260  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.85 
 
 
343 aa  260  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.94 
 
 
347 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.78 
 
 
347 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  41.46 
 
 
344 aa  259  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  40.73 
 
 
375 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.62 
 
 
373 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  40.5 
 
 
382 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.85 
 
 
349 aa  258  8e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.81 
 
 
364 aa  258  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.94 
 
 
373 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  41.09 
 
 
350 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3068  radical SAM protein  41.83 
 
 
413 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  40.28 
 
 
425 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  39.67 
 
 
402 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>