More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09940 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  100 
 
 		 349 aa  715    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.7 
 
 		 349 aa  344  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.85 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  48.68 
 
 		 349 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.96 
 
 		 364 aa  335  9e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.37 
 
 		 342 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  49.4 
 
 		 350 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.76 
 
 		 341 aa  325  9e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.2 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.82 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.99 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.51 
 
 		 361 aa  323  4e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.24 
 
 		 362 aa  322  8e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.24 
 
 		 362 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.24 
 
 		 362 aa  322  8e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.24 
 
 		 362 aa  322  8e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.24 
 
 		 362 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.24 
 
 		 362 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.24 
 
 		 362 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.7 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  46.97 
 
 		 351 aa  319  5e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.91 
 
 		 362 aa  319  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.95 
 
 		 362 aa  318  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0188  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.14 
 
 		 365 aa  318  7e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  47.34 
 
 		 342 aa  318  7e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.49 
 
 		 364 aa  318  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.49 
 
 		 364 aa  318  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  48.26 
 
 		 360 aa  317  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.77 
 
 		 371 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  47.95 
 
 		 371 aa  317  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.13 
 
 		 363 aa  316  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.38 
 
 		 362 aa  315  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.8 
 
 		 347 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  46.75 
 
 		 382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  45.22 
 
 		 357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  45.93 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  46.82 
 
 		 370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  45.75 
 
 		 372 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.46 
 
 		 347 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  44.54 
 
 		 376 aa  311  9e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  45.75 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  45.45 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  45.13 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.16 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.51 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.65 
 
 		 351 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  45.97 
 
 		 382 aa  309  4e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  49.54 
 
 		 348 aa  309  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.93 
 
 		 355 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  45.78 
 
 		 356 aa  309  5.9999999999999995e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.62 
 
 		 381 aa  308  6.999999999999999e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4182  radical SAM protein  45.38 
 
 		 374 aa  308  6.999999999999999e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  45.17 
 
 		 364 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.3 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.65 
 
 		 340 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.15 
 
 		 343 aa  305  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.84 
 
 		 355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.77 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  43.99 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.73 
 
 		 358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  44.08 
 
 		 374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  44.08 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  47.16 
 
 		 408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  44.7 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.36 
 
 		 351 aa  303  4.0000000000000003e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.44 
 
 		 349 aa  302  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  46.04 
 
 		 348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40320  hypothetical protein  44.57 
 
 		 381 aa  302  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  45.1 
 
 		 373 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.98 
 
 		 351 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  45.1 
 
 		 382 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  44.92 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  45.64 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  45.43 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  43.47 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  45.4 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  46.84 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.64 
 
 		 399 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  44.13 
 
 		 382 aa  299  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.65 
 
 		 356 aa  299  4e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  43.27 
 
 		 382 aa  298  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.03 
 
 		 343 aa  298  7e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  44.19 
 
 		 381 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  44.19 
 
 		 381 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  44.19 
 
 		 381 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  43.9 
 
 		 381 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.74 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.32 
 
 		 343 aa  297  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  42.98 
 
 		 382 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.61 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  44.13 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.74 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.85 
 
 		 356 aa  296  4e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.38 
 
 		 373 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.55 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.09 
 
 		 373 aa  296  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.48 
 
 		 373 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.8 
 
 		 373 aa  295  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  44.51 
 
 		 382 aa  295  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>