More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_16851 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_16851  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 		 348 aa  709    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1574  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  91.38 
 
 		 348 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  88.76 
 
 		 347 aa  634    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16611  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  81.9 
 
 		 348 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.785393  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.59 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  52.19 
 
 		 351 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16031  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.53 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.02 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18821  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.87 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1012  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.57 
 
 		 359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.86 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.86 
 
 		 340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  47.67 
 
 		 367 aa  345  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.67 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.51 
 
 		 361 aa  342  5e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  49.26 
 
 		 345 aa  339  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.26 
 
 		 355 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  47.23 
 
 		 356 aa  332  5e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12087  predicted protein  44.95 
 
 		 340 aa  289  6e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49687  predicted protein  41.81 
 
 		 369 aa  282  7.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.622489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  42.04 
 
 		 349 aa  257  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1539  radical SAM protein  39.5 
 
 		 363 aa  251  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.177286  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  40.56 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3115  radical SAM enzyme, Cfr family  37.43 
 
 		 353 aa  248  8e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248396  hitchhiker  0.0000000842526 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.02 
 
 		 347 aa  248  9e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  39.76 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.02 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  40 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  40.12 
 
 		 344 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  38.37 
 
 		 349 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3124  hypothetical protein  39.12 
 
 		 365 aa  245  9e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.31 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  39.82 
 
 		 344 aa  242  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  38.16 
 
 		 357 aa  242  7.999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  39.22 
 
 		 378 aa  239  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0825  hypothetical protein  38.75 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.76 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  40.11 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  40.54 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.46 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.87 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.46 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.46 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.46 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  35.93 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.46 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.46 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.46 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.17 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3089  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.49 
 
 		 360 aa  233  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.929572  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.46 
 
 		 364 aa  232  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.46 
 
 		 364 aa  232  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.13 
 
 		 343 aa  232  6e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.17 
 
 		 362 aa  232  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.31 
 
 		 365 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07736  hypothetical protein  35.84 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1782  radical SAM protein  36.99 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.69 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  36 
 
 		 382 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3855  radical SAM enzyme, Cfr family  38.53 
 
 		 348 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.74079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.84 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1508  radical SAM enzyme, Cfr family  37.29 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.868502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  36 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14130  radical SAM enzyme, Cfr family  37.32 
 
 		 351 aa  229  4e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  37.07 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.47 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  37.98 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  34.38 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  36.29 
 
 		 382 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  34.9 
 
 		 383 aa  229  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  37.31 
 
 		 342 aa  228  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  33.98 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  35.08 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.41 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  38.62 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  35.77 
 
 		 376 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  35.23 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1414  radical SAM enzyme, Cfr family  36.04 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0444  hypothetical protein  37.32 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1166  radical SAM enzyme, Cfr family  36.24 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.565735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  33.43 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  34.64 
 
 		 382 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  33.8 
 
 		 364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  34.82 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.71 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  35.18 
 
 		 382 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  35.8 
 
 		 365 aa  225  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  35.38 
 
 		 383 aa  225  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  39.21 
 
 		 408 aa  225  9e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  36.2 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  37.62 
 
 		 318 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.46 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.48 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4986  radical SAM enzyme, Cfr family  37.84 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.323052  hitchhiker  0.00454129 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.19 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.39 
 
 		 347 aa  224  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  36.29 
 
 		 369 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2087  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.9 
 
 		 356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122222  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  33.7 
 
 		 383 aa  222  9e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>