More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1323 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  100 
 
 
348 aa  728    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  61.06 
 
 
364 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.47 
 
 
365 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.05 
 
 
362 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.93 
 
 
362 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.93 
 
 
362 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.93 
 
 
362 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.93 
 
 
362 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.64 
 
 
362 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.93 
 
 
362 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.93 
 
 
362 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.93 
 
 
362 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.93 
 
 
362 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.34 
 
 
362 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.05 
 
 
364 aa  401  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.46 
 
 
364 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.05 
 
 
364 aa  401  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.9 
 
 
347 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.9 
 
 
347 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.85 
 
 
342 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  52.91 
 
 
349 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  52.46 
 
 
356 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  53.17 
 
 
350 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.24 
 
 
341 aa  364  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.74 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  50.29 
 
 
360 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.71 
 
 
389 aa  340  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.82 
 
 
349 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  46.65 
 
 
351 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.99 
 
 
368 aa  325  6e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0188  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.83 
 
 
365 aa  324  1e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  50 
 
 
318 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  45.11 
 
 
348 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  46.04 
 
 
349 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  43.43 
 
 
351 aa  293  4e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.27 
 
 
343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  43.02 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  42.86 
 
 
371 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0665  radical SAM enzyme, Cfr family  41.28 
 
 
341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.11 
 
 
343 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.78 
 
 
363 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  44.64 
 
 
372 aa  278  9e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.88 
 
 
361 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  41.18 
 
 
382 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4182  radical SAM protein  44.84 
 
 
374 aa  276  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.86 
 
 
361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  43.9 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  45.06 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  43.9 
 
 
372 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  43.9 
 
 
372 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  44.81 
 
 
408 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  40.73 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  41.54 
 
 
376 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  44.41 
 
 
367 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.39 
 
 
399 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.33 
 
 
347 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3115  radical SAM enzyme, Cfr family  42.77 
 
 
353 aa  266  4e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248396  hitchhiker  0.0000000842526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.97 
 
 
399 aa  265  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  40.51 
 
 
371 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  39.6 
 
 
392 aa  264  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  38.57 
 
 
357 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  40.68 
 
 
384 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  38.46 
 
 
382 aa  263  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  37.11 
 
 
365 aa  262  6e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  41.07 
 
 
357 aa  262  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0426  radical SAM enzyme, Cfr family  41.52 
 
 
359 aa  262  6.999999999999999e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.11 
 
 
340 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.24 
 
 
348 aa  261  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 
342 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  40.66 
 
 
369 aa  260  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  39.27 
 
 
373 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  41.33 
 
 
366 aa  260  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  40 
 
 
377 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  41.69 
 
 
428 aa  260  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  40.4 
 
 
384 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  39.33 
 
 
374 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  39.89 
 
 
382 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0596  radical SAM enzyme, Cfr family  37.68 
 
 
353 aa  259  7e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.81 
 
 
340 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  39.33 
 
 
383 aa  258  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  37.86 
 
 
370 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  37.86 
 
 
370 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  40.4 
 
 
383 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  42.37 
 
 
359 aa  257  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  41.72 
 
 
378 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  37.91 
 
 
402 aa  257  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  44.85 
 
 
364 aa  256  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  40.11 
 
 
383 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1657  radical SAM enzyme, Cfr family  40.95 
 
 
401 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33058  normal  0.466299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  39.44 
 
 
394 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0834  radical SAM protein  40.11 
 
 
428 aa  256  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0281827 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  40.92 
 
 
344 aa  255  8e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  40.11 
 
 
383 aa  255  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.38 
 
 
356 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.65 
 
 
358 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  38.75 
 
 
393 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  39.94 
 
 
382 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  39.83 
 
 
382 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  39.38 
 
 
375 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>