More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1313 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  100 
 
 		 360 aa  735    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  53.59 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.91 
 
 		 364 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  51.34 
 
 		 349 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.31 
 
 		 365 aa  352  7e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.09 
 
 		 342 aa  347  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  50.29 
 
 		 348 aa  343  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  52.85 
 
 		 318 aa  341  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.42 
 
 		 362 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50 
 
 		 362 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50 
 
 		 362 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50 
 
 		 362 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50 
 
 		 362 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50 
 
 		 362 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50 
 
 		 362 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.71 
 
 		 362 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.8 
 
 		 341 aa  334  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.58 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.58 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.42 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.84 
 
 		 362 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.26 
 
 		 349 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.12 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.43 
 
 		 349 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.34 
 
 		 347 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.04 
 
 		 347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  48.26 
 
 		 349 aa  317  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  43.93 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  44.51 
 
 		 351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  46.73 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.67 
 
 		 368 aa  300  4e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.97 
 
 		 389 aa  298  7e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  46 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  47.08 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  46.49 
 
 		 408 aa  291  9e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3115  radical SAM enzyme, Cfr family  44.19 
 
 		 353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248396  hitchhiker  0.0000000842526 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  46.58 
 
 		 348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  46.18 
 
 		 356 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0188  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.51 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  45.57 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.4 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.02 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  44.84 
 
 		 342 aa  275  8e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.21 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.63 
 
 		 361 aa  271  9e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.68 
 
 		 355 aa  271  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.03 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1388  radical SAM enzyme, Cfr family  44.71 
 
 		 462 aa  268  8e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.05 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.69 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.78 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  41.14 
 
 		 357 aa  265  7e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  44.44 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  42 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  43.07 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  44.44 
 
 		 374 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  44.74 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  44.44 
 
 		 383 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  43.16 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.23 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.15 
 
 		 351 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.35 
 
 		 351 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  43.3 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.65 
 
 		 360 aa  262  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  44.15 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.74 
 
 		 351 aa  262  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  44.88 
 
 		 382 aa  262  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  41.9 
 
 		 344 aa  262  8.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  40.97 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.76 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  44.85 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.31 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.65 
 
 		 367 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  43.11 
 
 		 345 aa  260  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4182  radical SAM protein  42.52 
 
 		 374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  41.6 
 
 		 364 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.52 
 
 		 347 aa  259  7e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  41.93 
 
 		 357 aa  259  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.94 
 
 		 346 aa  258  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  43.84 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.23 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.65 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16031  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.69 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0665  radical SAM enzyme, Cfr family  39.71 
 
 		 341 aa  256  4e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.94 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.34 
 
 		 351 aa  256  6e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.81 
 
 		 421 aa  255  8e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  42.14 
 
 		 371 aa  255  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.14 
 
 		 351 aa  255  9e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0444  hypothetical protein  45.78 
 
 		 355 aa  255  9e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  44.98 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.88 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  42.2 
 
 		 393 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  42.77 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  42.86 
 
 		 342 aa  252  6e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0426  radical SAM enzyme, Cfr family  42.38 
 
 		 359 aa  252  7e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1657  radical SAM enzyme, Cfr family  40.11 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33058  normal  0.466299 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  41.34 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  43.37 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>