More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3850 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  100 
 
 
357 aa  739    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  45.22 
 
 
349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  44.8 
 
 
354 aa  306  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  43.34 
 
 
357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.74 
 
 
348 aa  293  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  44.51 
 
 
408 aa  291  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.31 
 
 
347 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.44 
 
 
349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.02 
 
 
347 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.4 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.04 
 
 
362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.43 
 
 
341 aa  286  5e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.46 
 
 
362 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.92 
 
 
362 aa  285  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 
362 aa  285  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.16 
 
 
342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.27 
 
 
364 aa  282  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.27 
 
 
364 aa  282  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.62 
 
 
364 aa  282  7.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 
362 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  42.15 
 
 
349 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  44.44 
 
 
350 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  41.21 
 
 
372 aa  276  3e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.66 
 
 
363 aa  277  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.23 
 
 
343 aa  276  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.88 
 
 
365 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  45.91 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0596  radical SAM enzyme, Cfr family  41.36 
 
 
353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.64 
 
 
343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.4 
 
 
347 aa  270  4e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.57 
 
 
340 aa  270  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40 
 
 
364 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.44 
 
 
354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  42.57 
 
 
371 aa  266  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  43.03 
 
 
348 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.03 
 
 
361 aa  266  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0665  radical SAM enzyme, Cfr family  38.71 
 
 
341 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0188  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.5 
 
 
365 aa  264  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.99 
 
 
361 aa  263  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  41.16 
 
 
384 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  38.4 
 
 
356 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  43.06 
 
 
372 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.57 
 
 
389 aa  263  3e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  41.09 
 
 
374 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  40.58 
 
 
384 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  41.09 
 
 
383 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  41.07 
 
 
348 aa  262  6e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  43.58 
 
 
356 aa  262  6.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  41.03 
 
 
393 aa  262  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  41.04 
 
 
342 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  40.29 
 
 
383 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  42.77 
 
 
372 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  40.29 
 
 
383 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.15 
 
 
368 aa  261  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  39.72 
 
 
371 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  39.83 
 
 
351 aa  260  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  42.49 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  41.09 
 
 
394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  41.93 
 
 
360 aa  259  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4182  radical SAM protein  40 
 
 
374 aa  259  7e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  38.68 
 
 
378 aa  259  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  41.89 
 
 
359 aa  258  8e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  39.44 
 
 
383 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.52 
 
 
371 aa  258  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  40.57 
 
 
364 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1905  radical SAM protein  37.5 
 
 
403 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  40.06 
 
 
382 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  43.08 
 
 
318 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  39.66 
 
 
397 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  37.54 
 
 
358 aa  256  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  38.36 
 
 
402 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  42.21 
 
 
364 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.39 
 
 
355 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4986  radical SAM enzyme, Cfr family  39.83 
 
 
349 aa  255  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.323052  hitchhiker  0.00454129 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0679  hypothetical protein  37.25 
 
 
409 aa  255  9e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.58 
 
 
340 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  38.62 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0648  hypothetical protein  37.25 
 
 
413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  39.48 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.56 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.32 
 
 
344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0083  radical SAM protein  39.61 
 
 
391 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  40.24 
 
 
382 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  39.77 
 
 
382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.33 
 
 
356 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  41.64 
 
 
345 aa  253  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.28 
 
 
340 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  40.35 
 
 
381 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  39.72 
 
 
403 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.95 
 
 
399 aa  252  9.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  39.66 
 
 
375 aa  252  9.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  38.86 
 
 
351 aa  251  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  38.33 
 
 
382 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  40.06 
 
 
381 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>