More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1574 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1574  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 		 348 aa  710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16851  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  91.38 
 
 		 348 aa  653    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  89.05 
 
 		 347 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16611  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  81.9 
 
 		 348 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.785393  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.59 
 
 		 351 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.9 
 
 		 351 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16031  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  52.65 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.44 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18821  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.57 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1012  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.27 
 
 		 359 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.83 
 
 		 340 aa  348  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.83 
 
 		 340 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  46.22 
 
 		 367 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.49 
 
 		 355 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  47.81 
 
 		 356 aa  338  5.9999999999999996e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.75 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.35 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  47.2 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49687  predicted protein  42.09 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.622489 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12087  predicted protein  44.65 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1539  radical SAM protein  39.06 
 
 		 363 aa  251  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.177286  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  41.14 
 
 		 349 aa  250  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  38.44 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  40.62 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  38.24 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3115  radical SAM enzyme, Cfr family  36.52 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248396  hitchhiker  0.0000000842526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.88 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3124  hypothetical protein  38.24 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  38.89 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  40.61 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.57 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.57 
 
 		 347 aa  242  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  40.54 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.57 
 
 		 342 aa  239  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  37.28 
 
 		 349 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  38.77 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.65 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.35 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3089  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.77 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.929572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  39.83 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  34.09 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  37.64 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0825  hypothetical protein  37.61 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.86 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  38.02 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.41 
 
 		 344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.67 
 
 		 356 aa  232  6e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 		 356 aa  232  6e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.15 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.15 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.15 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.15 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.15 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.15 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.15 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.15 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3855  radical SAM enzyme, Cfr family  38.53 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.74079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14130  radical SAM enzyme, Cfr family  35.86 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2087  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.48 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122222  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1782  radical SAM protein  37.54 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1508  radical SAM enzyme, Cfr family  37.08 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.868502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.66 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.15 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.66 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.84 
 
 		 365 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.21 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.78 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.97 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  37.69 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07736  hypothetical protein  35.84 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.84 
 
 		 343 aa  229  6e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1166  radical SAM enzyme, Cfr family  36.52 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.565735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  35.86 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.55 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  35.01 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  33.7 
 
 		 373 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.7 
 
 		 371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.63 
 
 		 358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1414  radical SAM enzyme, Cfr family  34.91 
 
 		 361 aa  225  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.85 
 
 		 358 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  38.3 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  33.7 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  35.71 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  34.36 
 
 		 382 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.12 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  35.38 
 
 		 384 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  36.88 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  35.23 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  34.63 
 
 		 382 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0444  hypothetical protein  35.86 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  36.69 
 
 		 342 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.21 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1567  hypothetical protein  36.02 
 
 		 346 aa  222  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00430195  hitchhiker  0.00703244 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  33.7 
 
 		 383 aa  222  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  33.7 
 
 		 374 aa  222  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.43 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  34.84 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.19 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  35.89 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  34.35 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>