More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1414 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1414  radical SAM enzyme, Cfr family  100 
 
 		 361 aa  751    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1539  radical SAM protein  55.52 
 
 		 363 aa  421  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.177286  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1508  radical SAM enzyme, Cfr family  55.93 
 
 		 359 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.868502  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0951  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.81 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1166  radical SAM enzyme, Cfr family  51.55 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.565735 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1427  radical SAM enzyme, Cfr family  49.72 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0825  hypothetical protein  50.57 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3115  radical SAM enzyme, Cfr family  40.7 
 
 		 353 aa  262  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248396  hitchhiker  0.0000000842526 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3124  hypothetical protein  42.23 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  39.53 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  38.79 
 
 		 344 aa  253  5.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3855  radical SAM enzyme, Cfr family  40.63 
 
 		 348 aa  251  9.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.74079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0483  radical SAM enzyme, Cfr family  40.46 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0926837  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.59 
 
 		 361 aa  249  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07736  hypothetical protein  38.07 
 
 		 346 aa  246  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  38.35 
 
 		 356 aa  245  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1782  radical SAM protein  37.89 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  37.54 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0426  radical SAM enzyme, Cfr family  38.92 
 
 		 359 aa  242  9e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  35.67 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  37.82 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.6 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4986  radical SAM enzyme, Cfr family  37.89 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.323052  hitchhiker  0.00454129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  36.08 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  39.7 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.61 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  39.53 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1204  radical SAM enzyme, Cfr family  37.96 
 
 		 347 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110623 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3089  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.38 
 
 		 360 aa  236  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.929572  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16611  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.58 
 
 		 348 aa  235  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.785393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.08 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  38.82 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  37.32 
 
 		 382 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.08 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  37.72 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  36.99 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.05 
 
 		 340 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  37.98 
 
 		 366 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  38.75 
 
 		 392 aa  232  8.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  37.61 
 
 		 381 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  37.32 
 
 		 381 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  37.32 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  37.32 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.44 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40320  hypothetical protein  37.75 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  38 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.57 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  37.71 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.11 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.8 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  36.69 
 
 		 383 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.76 
 
 		 340 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  36.46 
 
 		 377 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.39 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.6 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  37.39 
 
 		 371 aa  229  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35 
 
 		 373 aa  228  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  36.69 
 
 		 383 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  36.69 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  38.44 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.86 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.81 
 
 		 348 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  36.89 
 
 		 369 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  38.44 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16851  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.04 
 
 		 348 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  36.21 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  36.16 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.79 
 
 		 340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.56 
 
 		 373 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1388  radical SAM enzyme, Cfr family  38.02 
 
 		 462 aa  226  6e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1347  radical SAM protein  36.29 
 
 		 378 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2230  radical SAM protein  36.29 
 
 		 378 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2357  radical SAM protein  36.29 
 
 		 378 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1109  radical SAM protein  36.29 
 
 		 378 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545154  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1574  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.91 
 
 		 348 aa  225  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  36.29 
 
 		 378 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  36.52 
 
 		 360 aa  226  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2192  radical SAM protein  36.29 
 
 		 378 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.83 
 
 		 373 aa  225  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1837  radical SAM protein  36.29 
 
 		 378 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.83 
 
 		 373 aa  225  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.28 
 
 		 373 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.28 
 
 		 373 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1429  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.83 
 
 		 373 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0876618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  36.75 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  36.75 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2232  radical SAM protein  36.02 
 
 		 378 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.28 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.81 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  38.37 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.56 
 
 		 373 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.83 
 
 		 373 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.83 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  35.76 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  35.9 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  36.55 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.43 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5115  hypothetical protein  36.8 
 
 		 379 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.34 
 
 		 347 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>